检测4种手部非结核分枝杆菌感染的多重PCR方法的建立

来源 :遵义医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ligang_nc1
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目的:建立一种特异、敏感、快速的检测海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌的双重PCR和胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌的三重PCR方法,为临床快速鉴定手部非结核分枝杆菌感染的早诊断、早治疗提供检测方法。  方法:在GeneBank数据库和文献中分别查找出海分枝杆菌、胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌4种手部常见NTM的特异基因序列,根据上述四种细菌的特异基因序列用 NCBI/Primer-BLAST软件系统设计各自引物序列,并用MFEPrimer-2.0软件筛选出特异的、相互间无互补或互补配对较少的引物分别构建海、溃疡分枝杆菌的双重PCR和胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌3种NTM的三重PCR。将从菌种库购买的海分枝杆菌、胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌4种标准菌株进行增殖培养,培养后将菌落移至无菌的营养肉汤中培养1~2天进行标准菌DNA的提取。用海、溃疡、胞内、龟分枝杆菌的DNA与相应细菌的引物进行单重 PCR扩增验证引物的特异性,再用海分枝杆菌的引物、溃疡分枝杆菌的引物分别和海、溃疡分枝杆菌的DNA扩增验证双重PCR的特异性,同理,用胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌的特异性引物和胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌的DNA扩增验证三重PCR的特异性。同时,根据双重PCR、三重PCR各自的引物的退火温度,摸索最佳退火温度,优化实验条件。将构建的两个多重PCR用于14例考虑手部NTM感染标本的检测。  结果:  1.用成功构建的两个多重PCR检测14例临床手部考虑NTM感染标本,检出率为93%;  2.海、溃疡分枝杆菌的双重PCR、胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌的三重 PCR最佳退火温度分别是57.5℃、58.6℃;  3.两个多重 PCR检测临床手部NTM感染标本的时间大约是6小时,较传统实验室鉴定NTM时间短。  结论:本研究构建的两个多重PCR可鉴定引起手部感染的海分枝杆菌、胞内分枝杆菌、溃疡分枝杆菌、龟分枝杆菌的常见NTM,可早期、快速、可靠的检测出临床标本中的四种NTM。
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