【摘 要】
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目的:基于高通量测序技术通过对复发性鼻息肉组织m RNA差异性比较,筛选与复发性鼻息肉的发生、发展相关的mRNA,寻找潜在的复发性鼻息肉的作用靶点,为临床用药提供依据。方法:1.选取10例复发性鼻息肉患者的鼻息肉组织,以及10例鼻中隔偏曲、鼻骨骨折患者的正常鼻甲黏膜标本进行全转录组测序。2.使用Illumina Nova Seq6000测序仪,选用PE150模式对上述标本进行测序。使用edge R
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目的:基于高通量测序技术通过对复发性鼻息肉组织m RNA差异性比较,筛选与复发性鼻息肉的发生、发展相关的mRNA,寻找潜在的复发性鼻息肉的作用靶点,为临床用药提供依据。方法:1.选取10例复发性鼻息肉患者的鼻息肉组织,以及10例鼻中隔偏曲、鼻骨骨折患者的正常鼻甲黏膜标本进行全转录组测序。2.使用Illumina Nova Seq6000测序仪,选用PE150模式对上述标本进行测序。使用edge R对上述两组测得的reads进行比对,筛选出差异表达基因(筛选条件:q-value<=0.05,Fold-change>=2)。3.将上述基因在GO和KEGG数据库中进行GO和KEGG富集分析以及蛋白互作网络分析。结果:本研究通过转录组测序共检出32797个基因,其中实验组相对对照组的差异表达基因有552个,GO富集分析显示这些差异基因参与了STAT蛋白入核等生物过程,与免疫突触等细胞组分有关,与趋化因子受体活性等分子功能有关。KEGG富集分析发现复发性鼻息肉的发生发展可能与原发性免疫缺陷、粘蛋白型O-聚糖生物合成、唾液分泌等通路密切相关。之后,我们还构建了蛋白互作网络,并筛选出了节点度最高的中枢基因PTPRC,并发现其与原发性免疫缺陷通路密切相关,可能是治疗鼻息肉的一个潜在靶点。结论:1.利用全转录组测序及多种生物信息学工具,我们对复发性鼻息肉的基因表达谱进行了全面的分析,确定了如CD37、PRB1、MUC7、PTPRC等与复发性鼻息肉作用机制相关几个关键基因,原发性免疫缺陷、粘蛋白型O-聚糖生物合成、唾液分泌等与复发性鼻息肉作用机制相关的信号通路。2.通过蛋白互作网络分析,我们认为,PTPRC可能是复发性鼻息肉发生的一个潜在的重要因子。3.本研究结果可能为复发性鼻息肉患者的治疗策略提供新的视角,然而,需要进一步的实验和大样本量的额外研究来证实这些发现。
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