目的:分离培养临床标本中的军团菌，对来自沈阳地区分离的军团菌应用序列分型方法及脉冲场凝胶电泳方法进行同源性分析。　　方法:对盛京医院疑似军团菌感染患者的呼吸道标本进行军团菌的分离培养。复苏已经分离得到的22株军团菌，22株军团菌分别采集自2012年7月～2014年9月沈阳市2例军团菌感染患者、2家医院的生活用水及空调冷凝塔水和13家办公大楼的空调冷凝水。对22株军团菌应用血清凝集法，进行血清学分型。对22株嗜肺军团菌应用序列分型分析方法进行分型研究。应用AscI内切酶对22株军团菌进行脉冲场凝胶电泳，采用spss19.0软件对指纹图谱进行聚类分析。　　结果:22株军团菌共表现出3种血清型，血清1型的军团菌有20株，血清7型的有1株，血清8型的有1株。22株嗜肺军团菌序列分型共分为7个型别，5株出现新的ST型，分别为ST2345、ST2344、ST2406、ST2407和ST2408，1株军团菌为ST328型，有2株军团菌的asd及mip未能扩增出故未能得到ST型别，剩下的14株军团菌均为ST1型。脉冲场凝胶电泳将22株军团菌分为了14种基因型，其中SYC型为主要型别，共有7株菌。同一血清型菌株可呈不同基因型;同一地点可以分离出不同血清型及基因型的菌株;同一医院的冷却塔和生活用水中分离的军团菌有同源性。　　结论:沈阳地区的军团菌具有基因多态性;以嗜肺军团菌血清1型为主，其中ST1型居多，发现5种新的ST型别。部分地区水系中存在优势军团菌基因型;同一医院不同水系中存在军团菌的交叉污染，应彻底消毒，避免军团菌感染的暴发流行。