高温胁迫下坛紫菜基因组甲基化水平的初步分析

来源 :集美大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:cdelphi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
坛紫菜(Pyropia haitanensis)是我国南方沿海广泛栽培的的大型经济海藻,其产量占全国紫菜总产量的75%。近年来由于全球气候变暖的影响,高温烂苗、种质退化等问题严重制约着紫菜养殖业的可持续发展。国内已成功选育出多个耐高温品系,对其耐高温机制进行了初步研究,并从中发现甲基转移酶等调控DNA甲基化相关基因的表达水平在高温胁迫中发生了显著的变化,因此推测DNA甲基化在坛紫菜应答高温胁迫中发挥了重要的作用。本研究以福建省坛紫菜种质改良及应用实验室选育的坛紫菜耐高温品系Z-61叶状体为实验材料,测定其基因组在高温胁迫下的甲基化水平变化,并对受甲基化调控的基因进行进一步分析。主要实验结果如下:1.采用甲基化定量试剂盒和MSAP技术测定Z-61叶状体在高温胁迫处理0,12和144h的全基因组DNA甲基化水平。结果都表明,高温胁迫下Z-61叶状体基因组DNA在高温胁迫下会发生去甲基化现象,经甲基化差异位点比较共回收获得55条甲基化差异片段;2.对回收片段进行同源性分析发现其中有29条片段的甲基化位点位于基因内部,其余片段的甲基化位点可能位于非编码区或启动子上。29条甲基化调控的基因参与了许多生物学过程,包括非生物胁迫反应,细胞程序性死亡,光合作用,能量代谢,信号转导,蛋白质合成,转座子激活等;3.29条基因片段的表达水平分析表明,有18个片段的甲基化状态与RNA-seq的表达模式一致,而其余的11个基因在高温胁迫下表达量极低或几乎没有表达量。随后在18个片段中随机挑选8条基因,采用q RT-PCR验证高温胁迫下5条去甲基化基因和3条甲基化基因的表达水平,结果显示基因的甲基化状态与其表达水平高度相关;4.高温胁迫及去甲基化后高温胁迫处理坛紫菜叶状体的光合参数检测结果表明:两种胁迫下的光合参数的表达趋势基本一致,但添加5-aza C去甲基化后可以显著延长坛紫菜叶状体耐受高温的时间,增强叶状体在高温逆境胁迫下的保护能力。亚显微结构的观察结果进一步证明了添加5-aza C去甲基化会显著提高坛紫菜叶状体对高温的耐受性。
其他文献
背景与目的:许多研究表明血清CA19-9水平升高与胃癌更具攻击性的生物学行为有关。然而,关于CA19-9升高的胃癌的临床病理特征以及血清CA19-9水平对预后的影响的相关研究还是较
近年来,钍的化合物由于被认为是第四代反应堆的潜在核燃料而备受关注。清楚地了解钍化合物在核燃料循环的各个阶段中的物理性质和化学性质,对于开发和利用钍燃料是至关重要的。在本论文中,我们选取了两种钍化物(ThBC和ThP),采用基于密度泛函理论的第一性原理计算研究了它们的物理性质。对于ThBC体系,我们着重研究了它的力学和热力学性质;对于Th-P体系,我们系统研究了它在高压下的结构相变和物理性质。通过基
人们已经用多种QCD求和规则方法对*的耦合常数进行了研究。但是得到的结果并不太理想,和CLEO实验值2)*=17.9相比都偏小。本篇论文中我们选择矢量流(9?()(8()以及轴矢流(8?(0)5(0)作为内
目的:研究草乌甲素(Bulleyaconitine A,BLA)对LX-2细胞增殖、凋亡的影响;分析BLA对乙醛诱导后LX-2细胞外基质分泌情况及其潜在的机制。方法:1.体外培养肝星状细胞系LX-2细胞,
汞(Hg)在渔业养殖环境中的生物地球化学循环过程非常重要,因为其可以通过生物富集作用在鱼体内进行积累。抗生素被广泛用于治理鱼病,无论是甲基汞(MeHg)还是抗生素,在鱼体内
随着5G网络的兴起以及自动驾驶技术的普及,许多制造商都在争取着将自动驾驶车辆投入市场,这将极大地刺激自动驾驶技术的兴起,而定位技术将是一个关键的基础技术。然而定位技术现阶段还存在着巨大的挑战。一些像GNSS等的定位技术已经逐步的被应用与自动驾驶定位当中,而动态信息共享定位的新技术在自动驾驶定位技术中也逐步得到了重视。本文主要基于后验线性置信传播算法(PLBP)对自动驾驶车辆进行协作定位,该算法分为
甘薯在我国种植历史悠久,种植面积和产量均居世界首位,在国内粮食作物产量排名中位列第四,仅次于水稻、小麦和玉米,不仅可以作为粮食作物,在能源领域和保健功能上也发挥重要
目的:本研究旨在探讨脾弹性是否可以鉴别肝硬化患者轻度和中重度食道胃底静脉曲张,为临床医生的诊疗工作提供帮助。方法:从2017年10月-2019年12月收集诊断为肝硬化的患者,行
马铃薯是世界第四大作物,由卵菌Phytophthora infestans(Mont.)de Bary导致的晚疫病是马铃薯上的毁灭性病害,一直是限制马铃薯生产的一个关键要素。然而晚疫病菌生理小种进化
目的:通过生物信息学分析HOTAIR与hsa-miR-148b-3p是否存在结合,进而通过细胞学实验验证在乳腺癌细胞系中两者互作关系如何,为下一步探究两者调控机制提供方向。方法:本研究