由于技术创新本身的不确定性和巨大投入，集群企业常常会和供应商达成资源或者成本共担的协议来进行新产品的合作开发，实现资源互补，分摊成本和风险，这种供应链网络下，集群企业进行着横向和纵向的合作，形成创新的协同优势，合作创新成为集群企业核心竞争力主要源泉。　　本文主要研究内容包括三个方面:第一，主要是从供应链网络角度着重分析产业集群企业之间的合作关系以及构成的网络结构，并进一步分析横向企业之间合作创新行为与纵向企业之间的合作创新行为;第二，借鉴“社会关系学”理论，根据双方合作时间久度、合作交易频度、资源共享广度以及信息交换深度将合作创新行为分为强关系和弱关系两种类型;第三，利用现有理论和模型，对横向企业和纵向企业之间的合作创新进行实证分析，应用SPSS17.0软件对回收125份有效问卷进行了信度分析，相关分析和回归分析等多种统计处理，得到如下几个结论:(1)合作这一变量引入提高了模型的拟合优度，集群内企业之间的合作关系，尤其是垂直合作关系，对创新的影响是积极和重要的。(2)从供应链网络视角来看，纵向企业之间合作程度更密切，接近于强关系型合作创新，而横向企业合作创新则更接近于弱关系型合作创新。(3)控制变量中的科研水平、企业规模、销售收入三个变量对企业创新来说仍然是起主导作用，仍是企业创新的重要内部资源。　　基于以上实证成果，本文认为促进集群企业合作创新政策着力点主要有以下几个方面:(1)政府制定政策的出发点和目的应该是帮助企业实现合作化和网络化。(2)集群政策要始终把企业的主体地位放在第一位考虑。(3)集群政策制定应坚守“自上而下”和“自下而上”相统一的思路。(4)政府政策制定应以建立解决纠纷的良好机制，提供联系渠道为主要工作。