极地环境样品中的细菌系统进化组成分析

来源 :复旦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kmj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
采用不经培养的rRNA方法,对1999年采集的南极菲尔德斯半岛地区长城站附近的6份表层土壤样品、2001年采集自不同站位不同深度的52份南极海水样品以及2002年北极加拿大海盆不同站位不同深度的59份海水样品和冰站卤水、潜水等9份样品中的细菌群落系统进化组成进行分析.通过PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对从土壤样品中获得16SrRNA基因特征片段V3区序列进行分离.对南北极同一站位不同深度海水样品进行分析,发现在DGGE指纹图谱上电泳分离条带的组成和分布不完全相同,推测随着海水深度的变化,海水中的细菌组成可能发生变化.从极地海洋不同深度海水样品中获得序列常常同数据库中来自海洋环境尤其是极地海洋环境中的培养或未培养细菌16SrDNA序列或克隆序列具有较高相似性.从南北极海水样品中获得序列可归类为proteobacteria分类群、CFB群和G<+>细菌,其中以属于α、γ-proteobacteria分类群和CFB群的序列为主.从北极海冰样品中获得的序列与α、β、γ-proterobacteria分类群、CFB群和G<+>细菌的序列具有较高的相似性(90﹪~100﹪),其中α、γ-proterobacteria分类群和CFB群占优势.这同海冰下面的海水中的细菌组成相似.另外,对北极海水、海冰样品经过培养和不经培养获得的16SrRNA基因特征片段V3区序列进行分离比较,结果表明不经培养方法获得的DGGE条较多,更能真实反映自然环境样品中细菌的组成和分布.
其他文献
本实验室利用两种预测模型在全基因组范围内进行候选印记基因筛选,得到若干候选基因,本课题所研究的基因 Arfip2就是其中之一。该基因的以往研究多集中于其蛋白的功能,对该基因
目的 系统评价盐酸阿比多尔治疗中国人群呼吸道病毒感染的疗效与安全性.方法 计算机检索Embase、PubMed、Cochrane Library、中国知网、万方数据库及维普数据库中已发表的关
自从1985年Miller和Koblitz分别提出椭圆曲线密码体制后,ECC密码体制得到了国内外学者的广泛关注。与RSA相比,ECC密码体制有很多优越性,比如,更高的单比特安全强度,更小的硬
目的 比较化疗所致恶心呕吐(chemotherapy-induced nausea and vomiting,CINV)三联(阿瑞匹坦+昂丹司琼+地塞米松)与二联(昂丹司琼+地塞米松)预防方案的非药品次均医疗费用,并
在新型冠状病毒肺炎疫情流行期间,医院药学实验室为临床各部门提供常规治疗及科研相关服务,存在一定的感染暴露风险,实验室应高度重视,加强防控措施.本文基于目前新型冠状病
该研究构建了适宜的基因打靶载体,通过体细胞基因打靶来获得敲除α1,3GT基因的细胞系,并在此基础上展开相应的细胞方面的研究工作,为异种器官移植的深入研究打下良好基础.首
新型冠状病毒肺炎疫情给我国的公共卫生事业及传染病预防和控制工作带来了前所未有的挑战.突发重大传染病事件过程中常出现预防、治疗药品储备供应不足和不合理使用等问题,而
伴随着3G时代的到来,掌握微小区无线移动信道的传播特性对个人通信的无线传输技术的研究和开发以及无线通信网的设计、规划和优化都具有十分重要的意义。近年来在无线信道估
1 预检分诊工作rn1.1 规范设置 基层医疗机构设置预检分诊点,预检分诊点设置在医疗机构入口显眼处,配有醒目的标识导引,对不设发热门诊的机构应在门口张贴告示,告知本医疗机
期刊
该文以皇甫川砒砂岩不同密度的人工油松林为研究对象,从土壤水分、植物水分特征、光合作用及其养分状况等方面,对其生态响应进行了研究,并初步探讨了这种生境条件下油松林的