上市公司的代理问题主要有两层：第一层是股东与管理者之间的代理问题,第二层是大股东与中小股东之间的代理问题。在中国等新兴市场国家,由于股权高度集中,国有股一股独大等现象的普遍存在,大股东与中小股东之间所形成的所有权层面的代理问题更加严重和复杂,如何有效约束大股东对中小股东利益的侵占行为,保护中小股东的利益一直是学者们研究的重点。一般认为,在审计独立性既定的条件下,具有行业专长的审计师能够更准确地评价客户财务报表的合法性和公允性,提高审计质量,降低代理成本。我国学者的研究主要集中于代理成本与审计师选择、代理成本与审计需求以及审计师行业专长与盈余管理等方面,对审计师行业专长对代理成本的抑制作用的研究较少。本文主要研究代理成本与审计师行业专长之间的相关关系,进一步研究上市公司最终控制人性质对二者相关关系的影响,以期丰富了有关文献,为抑制控股股东代理成本,维护中小股东权益提供经验支持；考查最终控制人性质强弱对审计师行业专长作用的影响,为我国现行经济转轨背景下抑制控股股东代理成本,完善上市公司外部监督机制等问题提供参考意见。本文选取2008年至2010年沪深两市非金融类上市公司为研究样本,实证检验发现,在控制了公司规模、经营状况、财务风险等因素的影响后,代理成本与审计师行业专长显著负相关,相比于不具有行业专长的事务所,具有行业专长的事务所能够更有效地降低上市公司大股东代理成本。进一步,本文研究了上市公司最终控制人性质对审计师行业专长降低代理成本的作用的影响,结果表明,最终控制人为非政府的上市公司,审计师更能有效发挥行业专长,降低大股东的代理成本。而中央政府控制与地方政府控制对审计师行业专长抑制代理成本的削弱效应的强弱并不明显。