随着我国市场经济体制改革的逐步深化和我国企业面对加入WTO后的挑战增加，公司治理和内部控制在经济管理中地位的重要性日益凸现，公司治理与内部控制的研究已成为当前理论与实务工作中的热点与重点。可以说，一个健全的内部控制机制实际上是完善的公司治理结构的体现。反过来，内部控制的创新和深化也将促进公司治理结构的完善和现代企业制度的建立。 目前我国公司治理结构存在很多缺陷，如“一股独大”现象相当普遍，股权结构不合理，董事会、监事会难以承担受托责任，公司激励和约束机制不健全，公司内部存在严重的“内部人控制”现象等等。同时我国企业管理混乱、违法乱纪行为时有发生，一个重要原因在于缺乏有效的内部控制或内部控制实施不力。由于我国企业在内部控制体系建设方面起步较晚，时间短，缺乏经验，许多企业的内部控制基础薄弱，在其内部控制工作中存在许多的问题，这些都直接牵制或消极影响着现代企业的健康发展和高效运作。因此，加强和完善企业内部控制和公司治理已成为经济管理中的焦点问题之一。本文拟从研究公司治理与内部控制相互联系和相互影响的基础上，尝试把内部控制置于公司治理的微观环境中，将两者有机结合起来，创新地从理论和实践层面来探讨在公司治理下实现有效内部控制的机制。根据我国的现实情况，本文提出，为确保内部控制系统的持续有效运行，首先，要有一个适用的企业文化；其次，要有健全的公司治理结构和恰当的企业内部组织结构；第三，要建立优良的信息管理和科学的风险管理制度；第四，要有及时有效的会计处理和财务报告机制；最后，要具备监督检查与应急机制。