CTLA-4基因多态性与结直肠癌易感性的关联研究

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目的:对人群中细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4等位基因(CTLA-4)位点上rs231775及rs5742909多态性与结直肠癌易感性的关系进行分析研究。方法:本实验采用病例-对照研究。选取2013年2月-2015年2月,就诊于河北医科大学第四医院符合该实验条件的对象,其中结肠癌病人102例、直肠癌病人138例、正常人群147例。在患者知情同意的情况下,收集患者肿瘤疾病家族史和性别、年龄、吸烟史、饮酒史一般情况等信息。在无菌操作原则下采集5ml外周静脉血,应用蛋白酶K消化-氯化钠饱和盐析法提取白细胞中脱氧核糖核酸DNA;应用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)对CTLA-4基因rs231775、rs5742909两个SNP单核苷酸多态性位点的基因型及等位基因进行检测分析。对实验结果的统计学分析使用SPSS13.0版软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA):t检验方法分析病例-对照组间年龄差异;χ2检验方法分析病例-对照组间的性别差异、等位基因分布频率及基因型分布频率;logistic回归方法计算OR相对风险度的比值比(odds ratio,OR)和95%CI可信区间(confidence interval,CI);Hardy-Weinberg检验病例-对照组间基因型分布频率的遗传连锁平衡。对CTLA-4基因的rs231775A/G、rs5742909C/T两个SNPs位点应用2LD软件和EH软件进行联合分析,显著性差异的标准取P<0.05。结果:1对照组中rs231775A/G、rs5742909C/T基因型分布频率均符合Hardy-Weinberg遗传连锁平衡(P>0.05)。2结直肠癌发病风险与rs231775A/G基因多态性CTLA-4基因rs231775A/G位点上等位基因A和G在病例-直肠癌组中分布频率为10.9%和89.1%;在病例-结肠癌组中分布频率为10.3%和89.7%;在正常-对照组中的分布频率为17%和83%。病例-直肠癌组及结肠癌组中等位基因A和G分布频率分别与正常-对照组相比,差异均具有统计学意义(P均为0.035)。GG、AG两种基因型的分布频率在直肠癌组中分别为83.6%和16.4%;GG、AG两种基因型结肠癌组中的分布频率分别为83%和17%;在正常对照组中分别为71.8%和28.2%。直肠癌组及结肠癌组中GG、AG两种基因型分布频率分别与正常对照组相比,差异均具有统计学意义(P分别为0.019和0.044)。与携带AG基因型相比,携带GG基因型罹患结直肠癌的风险显著增加(OR=1.996,95%CI=1.112-3.585;OR=1.915,95%CI=1.012-3.621)。3结直肠癌发病风险与rs5742909C/T基因多态性CTLA-4基因rs5742909C/T位点上等位基因C和T在病例-直肠癌组中分布频率分别为79.7%和20.3%;在病例-结肠癌组中分布频率分别为79.4%和20.6%;在正常-对照组中分布频率分别为80.3%和19.7%。病例-直肠癌组及结肠癌组中等位基因C和T分布频率分别与正常对照组相比,差异均无统计学意义(P分别为0.867和0.814)。CC、CT两种基因型在直肠癌中的分布频率分别为63.0%和37.0%;CC、CT两种基因型在结肠癌中分布频率分别为67.0%和33.0%;在正常对照组中则为66.2%和33.8%。直肠癌组及结肠癌组CC、CT两种基因型分布频率分别与正常对照组对比,差异均无统计学意义(P分别为0.574和0.896)。与携带CC基因型相比,携带CT基因型罹患直肠癌的风险增高无统计学意义(OR=0.868,95%CI=0.530-1.421);与携带CC基因型相比,携带CT基因型罹患结肠癌的风险未见增高无统计学意义(OR=1.037,95%CI=0.600-1.794)。4采用EH软件和2LD软件对CTLA-4基因的rs231775A/G、rs5742909C/T两个SNPs位点进行联合分析。在结直肠癌病例组中rs231775A/G和rs5742909C/T之间存在连锁不平衡关系(D’=0.809),其中在正常健康组出现频率最高的单体型是rs231775G-rs5742909C(63.2%),其次为rs231775A-rs5742909T(17.3%)、rs231775A-rs5742909C(17.1%)和rs231775G-rs5742909T(2.5%)。单体型为rs231775G-rs5742909T可减少结直肠癌发病风险(OR=0.203,95%CI=0.048-0.869);而rs231775G-rs5742909C(OR=0.976,95%CI=0.723-1.319)、rs231775A-rs5742909T(OR=1.192,95%CI=0.818-1.737)、rs231775A-rs5742909C(OR=0.991,95%CI=0.674-1.458)单体型可能与结直肠癌发病风险无关。结论:1 CTLA-4基因rs231775A/G位点的多态性可能与我国北方结直肠癌易感性相关:rs231775位点等位基因G增加结直肠癌发病风险;与AG相比GG基因型增加了结直肠癌的发病风险。2 CTLA-4基因rs5742909C/T位点的多态性可能与我国北方结直肠癌易感性无关。3在结直肠癌中CTLA-4基因的rs231775A/G、rs5742909C/T两个位点之间存在连锁不平衡现象。单体型rs231775G-rs5742909T可减少结直肠癌发病风险。
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