合作创新已成为我国战略性新兴产业发展创新的主要模式,但其在发展过程中还存在着跨区域合作松散、企业主体地位缺失等问题。同时,我国属于发展中国家,市场机制还不完善,在合作创新网络的演进中治理机制尚不健全。因此需要对战略性新兴产业合作创新网络展开系统性研究,探讨如何构建和完善多元化的治理机制解决网络发展中存在的各种问题,促进合作创新网络的健康平稳运行,最终促进战略性新兴产业的整体发展。本文以广西北部湾经济区为例,对现有的针对战略性新兴产业合作创新网络的治理措施进行梳理,明确网络治理现状和模式。收集北部湾经济区电子信息产业近十年来的合作专利数据,利用社会网络分析方法,剖析在现行的治理模式下,北部湾经济区电子信息产业合作创新网络整体和各网络成员的发展现状。在此基础上,分析合作创新网络存在的问题和原因,结合企业、政府、大学与研究机构、中介机构的角色功能,构建以信任机制、权力机制、资源共享机制、沟通协商机制和环境保障机制五个机制为核心的合作创新网络多元治理机制,以期为北部湾经济区战略性新兴产业合作创新网络治理机制的完善提供参考。