随着社会科技水平的提高，科技创新对区域经济增长的贡献率呈现出增长的趋势。区域科技水平越高，在国际分工中的地位越高，产品的科技附加值也就越高，所以，科技水平高的区域往往能够在区域出口贸易中获得可持续发展。因此，越来越多的国家和地区争相抢占科技资源，发展科技创新水平，以图抢占未来经济和社会发展的先机。山东半岛蓝色经济区从建立以来，重视科技发展，加之频临黄海、渤海两大海洋，具备得天独厚发展贸易的地理优势，利用科技创新驱动出口贸易结构的转型，必将为蓝区深化改革，加快经济转型作出巨大贡献。　　本文通过分析科技创新对出口贸易结构影响的相关理论和文献，利用计量方法，从科技创新的投入和产出角度，分析得到蓝区科技创新对出口贸易结构的影响机制，并结合蓝区的区域现状，得到结论：技术市场成交额的提高对出口贸易结构向中高端升级具有促进作用，专利申请授权数量的增加带动整个市场出口贸易的数量的增加，R&D就业人员数量的增加对促进出口贸易结构转型无实质性影响。山东半岛蓝色经济区出口贸易结构的优化升级，是出口商品结构，出口贸易方式构成，出口市场结构，出口主体结构各个层面的优化和改善，仍需要政府、企业、科研机构的多方共同协作和努力。