伴随着我国社会国有经济体制改革的不断深入发展,经济进入新常态,做好内部控制对于提升行政事业单位服务效能,从源头扼杀腐败有着重大意义。然而长期以来,行政事业单位内部控制工作在制度执行、机构设置、风险防控与监督评价等方面,都存在着一定缺陷,分析和研究这些问题有利于进一步完善行政事业单位的内控制度,提升管理质效。本文从加强行政事业单位内部控制的重要性入手,对于国内外的相关研究进行研读,梳理出相关研究成果,对行政事业单位内部控制评价的目标等进行了进一步的明确,以行政单位的内部控制规范为基础,考虑咨询该领域专家等相关负责人的建议,对行政事业单位的内部控制评价指标体系进行了完善。本研究的实证部分主要采用层次分析法与德尔菲法相结合的方法,确定单位层面五要素与六大业务活动的指标重要性程度,并选取A高校这一特殊事业单位,对其内部控制运行情况开展定量分析和模糊综合评价。通过对A高校内部控制的评价分析,查找出学院内部控制薄弱环节并深入挖掘问题存在的原因,提出主要包括强化内控意识、引入风险责任制度、加强预算绩效评价、优化资产管理程序、搭建数据共享平台、创新内外监督形式等六项针对性举措,对学院的内部控制体系进行了优化。本文的研究,对于有关行政事业单位的内部控制评价等方面提供可参考的方法及模型,为内部控制优化提出有效建议。帮助A高校推动全面从严治党主体责任落实,持续提升内部管理水平及资金使用效率,有效防范舞弊和腐败的发生。