基因编码的三甲基硅氢谱核磁探针(TMSiPhe)揭示GPCRs跨膜螺旋对Arrestin的独立激活作用

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gorgeous1277
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蛋白质并非孤立存在的生物分子,而是依赖特定的三维空间结构与其他分子(小分子配体、蛋白质、核酸等)相互作用,共同执行功能。蛋白质与蛋白质之间的相互作用作为细胞生化反应网络中的主要组成部分,对其作用机制的表征对于理解生理、病理过程,设计药物分子具有重要指导意义。G蛋白偶联受体(GPCRs)作为最大的膜受体家族,通过检测识别胞外信号分子并偶联G蛋白或Arrestin蛋白将化学信号传递至胞内,从而调控众多生理过程[1]。因此对GPCRs信号复合物的结构表征是理解许多生理过程的基础,并在药物开发中发挥关键作用,在当前的上市药物中,三分之一以上是以GPCRs作为靶标的[2]。尽管近年来X-ray晶体学和冷冻电镜的迅速进展使这些复合物的结构表征成为可能,但这些方法依赖于所形成复合物的稳定性,并且常常只有刚性部分的结构细节才能在高分辨率下呈现。作为溶液相蛋白结构解析和动态性检测的有力工具,核磁共振(NMR)可以检测与瞬态复合物形成相关的关键信号,尤其是提供复合物柔性区域的动态结构信息,这是其他结构学方法所不易获得的。然而,由于通常的核磁共振实验中,对于分子量较大的蛋白样品进行信号峰的归属是一项复杂的甚至是困难的工作,而且需要相当多的样品量和长时程的检测,这项技术仍然难以广泛的应用于GPCRs信号复合物的相关研究[3],复合物结构和动态信息的缺失成为以GPCRs为靶标进行合理药物设计(Rational Drug Design,例如设计Arrestin蛋白功能偏向性的GPCR配体)的障碍[4-7]。因此,在本文中我们建立了一种新的策略:利用基于密码子扩展的非天然氨基酸(UAA)插入技术,在细胞内将4-三甲基硅基苯丙氨酸(TMSiPhe)特异性的引入到Arrestin蛋白特定位点,以三甲基硅基团作为核磁共振氢谱探针,检测GPCRs-Arrestin信号复合物的构象变化。TMSiPhe所具有的独特的核磁共振氢谱化学位移和高强度的共振吸收信号使其在很低的蛋白质浓度下(5~10μM)易于识别,采样时间甚至可以缩短到数分钟。并且该探针对结构的变化相当敏感,可以检测到蛋白质的活性状态,并测定相互作用的亲和力。进一步的,在配体/GPCRs/Arrestin信号复合体中检测到了受体跨膜核心(TM Core)区域对Arrestin蛋白构象的直接调控作用,这表明开发设计Arrestin蛋白偏向性的GPCRs配体可以避开内源性的偏向性途径(如不同细胞环境下GRK表达差异)。因此,我们新开发的策略,在关于GPCRs信号复合物的构象变化研究中具有独特的优势,为理解GPCRs的功能和合理设计具有作用偏向性的药物可提供结构数据。伴随GPCRs及其复合物的重组表达与纯化技术,细胞膜环境模拟技术,以及非天然氨基酸真核筛选系统和NMR脉冲序列的进一步成熟完善,TMSiPhe作为核磁探针将具有更为广阔的应用前景。另外值得注意的是,这也是有机硅化合物第一次作为基石在细胞内参与构成蛋白质,并且通过对进化筛选得到的氨酰tRNA合成酶进行X-Ray晶体衍射,获得了关键的结构信息,对蛋白酶的进化筛选工作以及硅掺杂生命的相关研究同样意义重大[8]。
其他文献
近年来,越来越多的大型活动在城市内举办,而大型活动散场时具有人数多、人流密度大等特点,需要快速对观众进行疏散,以免造成交通拥堵甚至踩踏事件的发生。因此,针对大型活动的疏散问题,研究基于调度算法的疏散方案用于加快观众的疏散具有一定的实际应用价值。虽然目前国内外众多学者对大型活动的疏散问题做了广泛的研究,但现有的疏散方案主要研究优化大型活动场地(源站点)周围的公交/巴士等交通工具的班次以及路线,忽略了
高等教育不仅可以对学生传授必需的知识和技能,而且可以为学生提供个性化的教学内容与环境,其中一个关键因素是个性化教材内容的难度是否适中以及是否能够提高学生的学习兴趣
粉刷石膏抹灰是一种新型的、绿色环保的抹灰形式,具有传统干混砂浆难以比拟的优点.创新性的采用激光冲筋粉刷石膏抹灰施工工法,重点从工法工艺流程及操作要点进行总结,以期为
处在当前新的发展时期,电力工程的建设发展就愈来愈重要,这是保障人们的生产生活的基础设施内容,建设过程中控制好施工质量就显得比较关键。但在具体的工程施工当中,存在的质
为了研究数字化核电厂主控室班组协调行为,结合国内外班组协调研究现状以及国内核电厂班组的特点,本文完成了以下主要工作:(1)基于功能-实体-机制-模式(Functions–Entities–M
随着我国社会主义新农村建设的发展,农村经济已经有了不小的收获.正基于此,国家也采取了一些相应的政策,推动农村改革的方案的实施,建设新农村公路,改善新农村经济,使我国新