近年来,国家颁布了各种各样的理论政策,明确指出教育系统要加快内部控制建设。民办高校随着发展的数量不断膨胀,已成为我国高等教育的重要组成部分,其在发展管理的道路上也会遇到不同的风险,特别是停办倒闭风险和被其他方收购兼并的风险。内控就是管理,控制是管理的外在表现形式,所以不管是从国家政策的要求上,还是民办高校自身内部发展需求上,民办高校都是有必要构建内部控制体系,通过规范管理、有效控制、防范风险,保证民办高校持续、健康的发展。本文主要采取文献研究和案例分析的方法,通过调查问卷和W民办高校的实地走访,实地探究其内部控制活动的现状,发现其内部控制活动中存在一系列问题:内控意识不强、监督机制不完善、信息与沟通不全、相容职务未能有效分离、部门制度不健全等问题。随后分析产生这些问题的具体原因:主要有民办高校内部控制建设制度的缺失和单位的体制其特有的特征以及教育经费来源单一等原因,最后从单位和业务两个层面提出完善内部控制的策略。当然,只有找出民办学校内部控制存在的问题,理清好现状,才能切实推进学校内部控制工作顺利开展。通过探究我国公办院校的内部控制制度,结合民办高校自身特点,以及未来的发展规划,构建适合自身发展的民办高校内部控制体系。本人以所在工作单位为例,能掌握一手资料,所提出的问题与对策在理论与实践上具有一定的实际意义,期望这小小的文章能为广东省民办教育事业尽一份绵薄之力。