本论文应用分子动力学模拟技术和液体核磁共振技术,对抗菌肽gaegurin4的抗菌机理和广谱杀菌剂嘧菌酯、新型高效仿生型杀菌剂Y5247、广谱性除草剂阔草清三种农药化合物与β-环糊精(β-CD)、羟丙基β-环糊精(HP-β-CD)的相互作用进行了研究。具体内容如下:1.运用分子动力学模拟软件GROMACS对两亲性抗菌肽gaegurin4在水溶液中及脂环境中的分子动力学行为进行了研究。研究发现gaegurin4在水中有解旋的趋势,这和文献报道的用液体核磁共振方法测得的gaegurin4在水溶液中以无规则卷曲形式存在的实验结果相一致。而在膜环境和膜/水界面环境中动力学模拟则发现该抗菌肽具有较强的结构稳定性,且呈现出了强烈的向脂双层膜内迁移的趋势,同时,使脂环境变得紊乱。肽链中的苏氨酸、赖氨酸与磷脂头部的强烈的相互作用(氢键)是肽与POPC膜结合的重要因素。2.选取β-环糊精,羟丙基-β-环糊精作为包合主体分子,三种农药化合物嘧菌酯、Y5247、阔草清作为客体分子,主要应用核磁共振技术,特别是ROESY、COSY等二维核磁共振技术分别对以上三种农药化合物与环糊精在溶液中的空间包合构型进行了研究并提出了可能的包合构型。具体的研究结果如下:客体分子均以嵌入芳环的方式被包合且分子的大小对包合影响很大。使用“连续变化法”推测出阔草清与环糊精的包合计量比为1:1,在溶液中同时存在两种包合构型且包合构型间存在交换包合。