南京国民政府统治时期,对蒙古地区推行改省设县的政令。导致了盟旗的法律地位变得模糊;省县和盟旗体制并存,盟旗管辖地域和省县交错;省县不断地侵犯盟旗的权益,政治上压迫、经济上剥削;蒙众遭受了深重的灾难。实际上在酝酿改省政令时,蒙古王公贵族就不断用各种方式表达不满和反对。但最终南京国民政府不顾蒙古王公的反对,推行改省设县的政令。掀起了蒙古王公贵族新一轮的反对活动:纷纷集会、组成代表团请愿等方式反抗。中央政府不得不决定召开蒙古会议,和蒙古王公贵族商讨蒙古盟旗体制和蒙古自治问题。在蒙古会议上讨论通过了《蒙古盟部旗组织法》,盟部旗的存在有了法律的依据,但该法案只字未提蒙古自治的问题。该法案权衡各方利益,但是各方利益都没得到满足。该法案并没有解决任何问题,矛盾依然存在,从这个角度讲该法案是失败的。从内容上来讲,提到设立盟民代表大会和旗民代表大会,体现了一定的民主色彩,具有一定的进步性,成为内蒙古上层近代民族蒙古民族"自治"、"自决"运动的一部分。南京国民政府时期蒙古法案的研究,对我国当代民族政策法规的制定有较高的历史借鉴和参考价值。