牛马SP110基因克隆及其与结核杆菌敏感性的关系研究

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Gzliao2
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
牛结核病是一种由结核分枝杆菌引起的慢性免疫疾病,在畜牧业中造成巨大的经济损失并且严重危害人类公共健康。近年来,研究人员对来自中国14个省份的总计2201份血液样本进行牛结核流行性调查研究,结果显示奶牛感染结核菌的阳性率达到6.4%。尽管消灭牛结核病的计划在发达国家已经取得显著成绩,但是据权威统计,在世界范围内每年由牛结核病造成的经济损失仍然高达30亿美元。在密集养殖的状态下,使牛群达到无结核病存在的状态所需要的成本相对较高,即需要定期进行严格的结核菌素皮肤试验,一旦发现感染,则进行屠杀清除程序。因此,具有持续性特点的控制方案的研究迫在眉睫。百年来,在世界范围内仅有极少数马结核病例见诸报道,研究人员普遍认为马属动物由于其特殊的身体素质,从而对结核分枝杆菌感染具有天然抵抗力。因此,深入研究非易感动物接触到结核分枝杆菌时的免疫应答反应有望揭示结核病的抗病机理,对于马属动物免疫系统抗结核关键调节蛋白的研究则是具有重要意义的开端。在人和小鼠的研究中,SP110核体蛋白是机体抵抗胞内寄生菌感染的重要遗传因素。但是,截至目前SP110基因在大型非灵长类动物中仍然未见有研究报道。探索牛和马各自SP110基因在抗结核菌感染过程中是否有功能差别,对于揭示牛和马本身对结核菌具有不同敏感性的遗传机理具有重要意义,也为培育抗结核牛品系寻找新思路奠定理论基础。本文主要从启动子活性、免疫激活及免疫杀伤等方面系统比较分析了牛和马各自的SP110基因转录本,主要结果如下:1.首次克隆发现牛SP110基因主要表达三种转录本。根据翻译的蛋白序列从长到短依次命名为ɑ、?和?。保守结构域分析显示,开放阅读框最长的SP110ɑ异构体具有四个保守结构域(Sp100,SAND,PHD和Bromo domain)。SP110?异构体具有包括Sp100和SAND结构域的N端序列。SP110?仅具有包括Sp100的N端序列,SAND之后的C端序列未被转录。2.首次克隆发现马SP110基因表达三种转录本。根据翻译的蛋白序列从长到短依次命名为Tv1、Tv2和Tv3。保守结构域分析显示,开放阅读框最长的Tv1异构体具有四个保守结构域(Sp100,SAND,PHD和Bromo domain)。Tv2和Tv3蛋白序列基本一致,都具有与Tv1相同的包括Sp100和SAND结构域的N端序列。Tv2相对于Tv1,由于可变剪切将Exon17删掉,引起了移码突变。Tv3是由于在Exon16之后转录提前终止而形成。3.首次克隆获得了牛和马SP110基因启动子。双荧光素酶报告实验显示,牛和马SP110基因启动子同人、小鼠SP110基因启动子一样,具有细胞特异性的转录活力。脂多糖(LPS)能抑制牛和马SP110基因启动子活力,结核菌本身能提高牛和马SP110基因启动子活力。牛和马SP110启动子在不同条件下转录活性均没有显著性差异。4.表达牛SP110ɑ和?能激活巨噬细胞、促进吞噬泡-溶酶体融合、提高诱导型一氧化氮合成酶的活力,进而显著性增强巨噬细胞抑制结核杆菌的活力。另外,组织蛋白酶(cathepsin B、D、L)和Caspase-1在牛SP110ɑ/?调控的巨噬细胞吞噬结核杆菌与抑制其生长的过程中发挥作用。而SP110?在这些免疫通路中效应相对较弱。5.表达马SP110 Tv1和Tv2能促进巨噬细胞向抑制结核杆菌生长的方向发展:增强IL-1和TNF-α等抗结核细胞因子的表达,并提高诱导型一氧化氮合成酶的活力,促使感染后期的巨噬细胞向凋亡方向发展来清除结核杆菌。Tv1在激活免疫通路上的效应要比Tv2/3相对较强。6.对比实验显示牛马SP110基因不同转录本对巨噬细胞都有不同程度的激活效应,牛SP110ɑ和马SP110-Tv1长转录本间对巨噬细胞活力影响无显著性差别,牛SP110?和马SP110-Tv2转录本间对巨噬细胞活力影响无显著性差别,牛和马各自的SP110长短转录本间对巨噬细胞活力影响有显著性差别。7.SP110基因表达模式对比显示,马单核细胞中两条SP110突变体都有一定的基础表达水平,结核菌感染刺激能提高两条突变体表达水平;而牛单核细胞中,SP110?始终是牛SP110基因的主要表达形式。对核酸序列进一步分析显示,牛SP110?和?的3’UTR末端存在A-rich motif,能够促进基因转录终止,从而使SP110短转录本的表达比例高。基于本文的研究结果,我们得出尽管牛和马自身应对结核菌感染时存在遗传差异,但是其SP110基因的启动子活性及基因本身的功能是不存在显著性差异的。而在面临结核菌感染时,牛和马SP110基因表达模式存在显著性差别。尤其是牛SP110?3’UTR末端潜在的终止序列,可能导致SP110转录提前终止,引起SP110ɑ/?表达量不足,进而引起牛对结核免疫保护不足。
其他文献
三型分泌系统效应蛋白(Type 3 secretion effectors,T3SEs)通过三型分泌系统(Type 3 secretion system,T3SS)可以直接进入真核生物细胞中发挥功能。T3SEs既是致病菌侵染宿主过程中的毒性因子,也是根瘤菌与其宿主豆科植物建立共生体系过程中的影响因子。根瘤菌的T3SEs有些与致病菌的T3SEs同源,有些则为根瘤菌所特有。根瘤菌的T3SEs也被称为结
氮素是植物必需的大量营养元素,广泛参与植物萌发、生长、开花和结实等诸多生理过程。为了维持作物较高的产量和品质,农民必须施加大量的氮肥。然而作物吸收利用氮素的效率并不高,只有30%-50%的氮素能被作物吸收。氮肥的大量施用不仅增加了作物生产的成本,而且造成严重的环境问题。因此,维持作物高产,同时减少氮肥使用量,已成为现代农业可持续发展必须要解决的问题。深刻理解植物吸收氮素的作用机制和解析植物氮素吸收
在气候系统中,湖泊通过改变不同时空尺度上陆面与大气间水热交换过程,对区域的天气和气候系统产生影响。由湖-气相互作用引起的中尺度过程不仅会改变区域气候特征,而且气候系统中不同大气环流尺度间的相互作用会影响区域和全球气候预报的准确性。本研究不仅探索了湖泊过程对区域及全球气候预报的影响,而且为湖泊气候过程的深入理解和气候预报技能的提高提供依据。在全球气候预报模式CFS(Climate forecast
DNA解旋酶在DNA复制、转录、调控和修复中发挥重要作用。RecQ家族解旋酶是一类ATP依赖性的解旋酶家族,其在维持基因组稳定性中起着核心作用。研究发现五个人类RecQ家族解旋酶中的三个缺陷会导致基因组不稳定、癌症易感性和过早衰老等相关的独特遗传疾病。RecQ家族解旋酶成员之间具有很多互不重叠的功能,但是其分子基础仍然不清楚。此外,该解旋酶家族的成员已被证明能够解决非典型的DNA结构,例如fork
随着高通量测序技术的快速发展,生命科学领域也进入了大数据时代。传统分析方法在应对数据量巨大、数据类型繁多以及增长极快的生物学大数据中存在诸多局限。本论文利用玉米大规模转录组数据,开展了转录组图谱构建、基因表达数据挖掘、unmapped RNA-Seq read应用和图基因组在转录组数据上的应用等四方面的生物信息学整合分析方法研究,并搭建了相应的生物信息学分析平台,为相关大规模转录组的分析工作提供了
交配行为是两性生殖昆虫生殖活动的重要步骤。在交配过程中,复杂的生殖器和腹部夹持结构起着重要作用。然而由于交配发生的隐秘性和复杂性,昆虫交尾机制研究迄今仍比较缺乏,创伤交配、进化权衡等特殊交配现象仅在少数类群中有报道。蝎蛉科Panorpidae是长翅目Mecoptera最大的科,已知近500种,拥有复杂的夹持结构和有趣的献礼行为。近年来,针对蝎蛉献礼行为的研究颇多,但交尾机制及其特殊结构的功能却长期
解旋酶普遍存在于真核生物、原核生物以及病毒体内,其功能涉及核酸代谢的各个途径,并参与介导多种细胞应激反应,其中包括细胞凋亡、衰老和自噬等,帮助细胞应对复制错误和内源性或外源性诱导的DNA损伤。此外,解旋酶途径出现缺陷将导致机体和组织的衰老以及神经系统缺陷等一系列问题。Pif1作为ATP依赖性的SF1B解旋酶,由于其在酵母中维持线粒体DNA稳定性所发挥的重要作用而被首次发现,目前所有真核生物和某些细
端粒酶是一种特殊的逆转录酶,它的核心催化区由蛋白质催化亚基—端粒酶逆转录酶(Telomerase reverse transcriptase:TERT)和RNA亚基—端粒酶RNA(Telomerase RNA:TER)两部分组成。与其他逆转录酶相比,端粒酶最大的特点就是能够以自身携带的一段RNA序列为模板,反复合成端粒DNA,从而解决真核生物线性染色体的末端复制问题,维护基因组的完整性。然而,端粒
蝎蛉科Panorpidae是长翅目Mecoptera最大的科,包含8属约500种。蝎蛉属Panorpa是蝎蛉科最早建立的属,物种多样性最为丰富,包含约270个物种。学者依据形态特征将不同区系的蝎蛉属物种划分为多个种团。中国地区雄性腹部第6节无臀角的蝎蛉被划分为大卫蝎蛉种团P.davidi group。该种团的物种在形态上存在较强的异质性,形态和分子系统发育表明,大卫蝎蛉种团是并系群,急需进行厘订。
基于石英晶体微天平(QCM)技术的生物传感器可以实时、无标记地检测生物分子的相互作用,获得亲和力和动力学等丰富的相互作用信息,为深入研究生物分子相互作用过程,进一步研究相互作用机理提供了一种强有力的检测手段,在科学研究、药物研发和疾病诊断等领域得到了广泛的应用。然而,在分子相互作用研究中,要想全面的分析生物分子的相互作用,仅依靠亲和力和动力学参数是远远不够的。生物分子结合和解离过程中的热力学参数(