柑橘属(Citrus L．)系芸香科(Rutaceae)柑橘亚科(Aurantinoideae)植物，主要分布于亚洲和亚热带地区，我国是柑橘的原产中心之一，资源丰富，无论是栽培品种，还是野生、半野生种以及天然或人工育成的杂种类型等都极为繁多，此外还拥有大量的近缘属植物。但自1753年林奈确立柑橘属(Citrus L．)以来，尽管它的系统分类比其他任何果树都更受重视，但有关该属的分类，特别是种的划分一直存在很大分歧。其原因一方面是柑橘植物本身芽变容易发生，种属间易杂交且杂种可孕，体细胞突变率高，无融合生殖占优势，人工栽培历史悠久，类型繁多，形态复杂。另一方面是研究者对柑橘演化过程的看法和采用的分类标准不同。目前较有影响的是Swingle(1943)的大种分类系统和Tanaka(1954)的小种分类系统，前者只承认柑橘属(Citrus L．)为16个种，而后者提出柑橘属(Citrus L．)多达162个种。 传统的分类主要利用生态、地理、形态和解剖学等方面的资料，现代植物分类学已和细胞遗传学、生物化学、数学联系在一起，使植物分类学由外部形态转向植物体的遗传组成和生理功能的研究，在反映种类间亲缘关系上要比传统的分类资料更直接，因此，对分类研究者来说，它们具有更大的吸引力。近年来，国内外学者在化学(次生物质、同工酶、数值分类、孢粉分类、细胞学分类、核型、带型与染色体行为)以及近来的RFLP、RAPD等方面的柑橘分类研究均取得了不同程度的进展。Scora(1975)提出的3个基本种的观点正得到越来越多的支持。 AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)技术是1993年由Zabeau和Vos发展起来的一种检测DNA多态性的遗传标记技术，由于其不受环境条件的限制，信息量大，灵敏度高，多态性好，可靠性强，而被认为是迄今为止最有效的分子标记技术，可广泛用于遗传多样性和种质鉴定、构建遗传图谱、基因定位、辅助标记育种等多项研究。 本实验利用AFLP技术对柑橘属(Citrus L．)及其近缘属的16个种(按施文格分类系统)87个生物型进行了分类鉴定和多样性分析。基因组DNA采用改进的CTAB法提取，获得了符合标准的DNA。同时，在AFLP实验中，采用银染检测技术代替放射性同位素，避免了同位素的危害，使操作更安全方便。数据以Treecon软件，采用UPGMA法分析，探讨了柑橘各属、种、品种之间的亲缘关系和宜昌橙(C．ichangensis Swing．)在柑橘分类中的地位，同时，本研究还对甜橙(C．sinensis Osb．)、香橙(C．junos．Tan．)、葡萄柚(C．paradisi Macf．)、红黎檬(C．limonia Osb．)等杂种的可能祖先作了推断。认为宜昌橙(C．ichangens Swing．)归入大翼橙类(Papeaa)更加合理。推测大种橙(C．macrosperma Guo．)是一原始的古老种。并认为金豆(F．hindsii var．chintou Swing．)、罗浮(F．margarita Swing．)、宁波金弹(F．crassfolia Swing．)三个生物型，它们虽聚于一类，但所处的距离水平却较远，因此认为它们在起源、进化过程中存在遗传背景的差异，是三个不同的种，即同意把宁波金弹(F．crassifolia Swing．)看成是一个独立的种。在本研究中，马蜂柑(C．hystrix)较之传统的分类，它和柑橘属(Citrus L．)、枳属(Poncirus)的相对关系发生了 应用 AFLP分子标记对柑橘属（C；trus）植物进行览别与系统分类研穴 变化，它并不与宜昌橙（C．ichangensis）。红河大翼橙（C．hongheensis YL．D．j聚在一起， 而与积属（Poncirm）聚于一类，但又靠近大翼橙（Popeda HasskX拘踢类（C．medicaX推测 其起源除与大翼橙仟Qpeda Hassk）有关以外，还可能与积属汐oncirus）有关。 舌橙（C．sinensis）和酸橙（C．aurantiunl）首先与宽皮柑本（C．reticulata Blanco．）聚在一起， 然后又与抽（C．g广andis）聚于一大类，因此推测甜橙（Csinensis抨酸橙（C．aurantiuop可能是 来源于宽皮柑丰（C．陀ticulata Blanco．）牙抽（C．grandis）的杂种。葡萄抽（C．paradisi Macf） 在较小的距离水平与甜橙（Csinensis）聚在一起，因此甜橙K．sinensis）可能是葡萄抽 K尸aradisi Macf）的亲本之一。资阳香橙（Q＂nos） 在 0·3 的距离水平与永顺蜜桔 K．reticulata Blanc）。土桔（．ta邮r皿 TnJ等聚在一起而与宜昌橙（C．ichangensi刀远离， 因此本文支持宽皮柑橘（C．reticulata BlancO）可能是资阳香橙（CJunoS）的亲本而宜昌橙 （C ichangensis）却不是其亲本这一观点。 从聚类图分析，首先可得到四大类群，即宽皮柑橘类（Creticulata Blanco．X拘椽类 （C。e功c叫、抽类K矿州冰J和大翼橙类o叩e血人前三者分处于树形图的3个极端位 置，包括了柑橘属（Citrus L．）的其他成员，是真正柑橘亚属沼ubgenus citrus夕的 3个 基本种，其它的种都是由这三个基本种衍生而来的。因此，本研究结果支持“三个基本 种”的观点。 由于柑橘AFLP分析是DNA结构的变异分析，在一定程度上反映了遗传组成的?