碱基切除修复基因hMTH1,hOGG1和MUTYH变异与2型糖尿病发病风险的研究

来源 :南京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zolono188
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
机体在化学氧化剂或自由基等外界环境刺激下,或是正常细胞代谢过程中均能产生活性氧簇(Reactive oxygen species, ROS),过量的ROS可造成细胞蛋白质,核酸和脂质大分子氧化损伤,破坏细胞氧化和抗氧化平衡状态,导致细胞功能失调。8-羟基鸟嘌呤(8-hydroxy-2’-deoxyguanosine,8-OHdG)是最常见DNA氧化损伤产物之一,在衰老和肿瘤的发生过程中起着重要作用。8-OHdG常作为氧化损伤的标志物之一。在DNA复制时,8-OHdG易于腺嘌呤(A)错配,造成G:C到T:A的颠换突变。人类mutT同源物1(human mutT homolog1, hMTH1),人类8-羟基鸟嘌呤糖基化酶(human8-oxoguanine glycosylase1, hOGG1)和人类mutY同源物(human mutY homolog, MUTYH)基因构成了8-OHdG修复通路的重要元件。2型糖尿病(Type2Diabetes Mellitus, T2DM)是一个多因素引起的代谢性疾病,典型特征是胰岛素抵抗和/或胰岛素分泌异常。ROS参与胰岛素抵抗,β细胞受损,糖耐量减退并最终导致T2DM及其并发症发生发展的一系列过程。DNA修复基因的多态性变异会改变蛋白功能并降低DNA修复功能,进而引起基因组不稳定,增加年龄相关疾病的发病风险率。探讨DNA修复基因多态性变异和T2DM发病风险的关系可以加深对疾病的遗传学方面的理解,并可能会对糖尿病的预防提供新的途径。本研究中,我们在年龄-性别匹配的T2DM病人和正常对照人群中进行hMTH1, hOGG1和MUTYH基因变异的筛查,探讨这些变异与T2DM发病风险的相关性。同时,在筛查T2DM病人hOGG1基因变异时发现了T2DM病人个别样本DNA疑似嵌合体状态,实验对其进一步的确认并探讨其对基因变异与疾病相关性分析的影响。第一部分:hOGG1基因启动子区嵌合型变异的发现及对多态性变异与疾病风险相关性分析的影响一、研究背景与目的嵌合体是指一个生物体或组织内含有不同遗传信息的细胞系的存在,体细胞嵌合体通常是体细胞产生突变的结果,主要出现在胚胎发育早期。本实验在研究hOGG15’-UTR区C.-53G>C (rs56387615), c.-23A>G (rs1801129)和c.-18G>T (rs1801126)变异与T2DM发病风险相关性时,在突变基因测序分析中发现某些T2DM病人DNA样本突变等位基因峰值较低,本实验探讨其性质及对疾病相关的多态性分析结果的影响。二、方法1.利用高分辨熔解曲线(High Resolution Melting, HRM)方法筛查T2DM病人和正常对照人群DNA样本中hOGG1基因5’-UTR c.-53G>C, c.-23A>G和c.-18G>T多态性变异的基因型。2.直接测序法确定筛查出的杂合型样本的多态性位点基因型。3.PCR产物克隆测序技术分析测序图中有异常突变小峰的DNA样本变异频率并确定其性质。4.焦磷酸测序技术和体外嵌合体模型确定嵌合体的存在。三、结果1. hOGG1基因5’-UTR区c.-53G>C变异的10.71%(3/28)、c.-23A>G变异的13.73%(7/51)和c.-18G>T的2.27%(1/44)呈现嵌合型的变异状态。2.焦磷酸测序技术和体外嵌合体模型支持了以上分析结果。3.病例-对照研究结合统计学分析发现,当嵌合型变异纳入杂合型变异,T2DM病人hOGG1基因5’-UTR区c.-23A>G多态性变异频率显著高于正常对照组,且有统计学意义(OR:2.173;95%CI:1.329-3.554); hOGG1基因5’-UTR区c.-53G>C或c.-18G>T多态性变异频率在病人与对照中无显著性差异;按性别分组时,男性T2DM病人hOGGl基因5’-UTR区c.-23A>G多态性变异频率也显著高于正常对照组,且有统计学意义(OR:2.828;95%CI:1.404-5.697),女性组中无差异性;按年龄分组(<60或>60岁),T2DM病人hOGG1基因5’-UTR区c.-23A>G A/G杂合子频率显著高于正常对照组,且有统计学意义(OR:1.974,95%CI1.071-3.640;OR:2.573,95%CI:1.121-5.908)4.当嵌合型变异不纳入杂合型变异,T2DM病人中hOGG1基因5’-UTR区c.-23A>G多态性变异A/G杂合子频率改变,与正常对照组差异性减小;按年龄分组(<60或>60岁)时,T2DM病人hOGG1基因5’-UTR区c.-23A>G A/G杂合子频率与正常对照组相比无显著性差异。四、结论我们在筛查hOGG1基因5’-UTR区c.-23A>G变异与T2DM发病风险关系时,在个别2型糖尿病患者DNA样本中发现hOGG1基因5’-UTR区嵌合型变异的存在。嵌合型的变异状态可能影响hOGG1基因5’-UTR区c.-23A>G多态性变异的检出,影响疾病关联基因变异分析的结果。第二部分:hMTH1, hOGG1和MUTYH基因多态性变异的联合作用与中国人群2型糖尿病发病风险的研究一、研究背景与目的ROS参与T2DM及其并发症的发生发展过程。hMTH1, hOGG1和MUTYH构成了8-OHdG修复通路的重要元件。本研究中,我们在中国人群T2DM患者和一般对照人群中筛查了hMTH1p.Val83Met (c.247G>A, rs4866)多态性变异,hOGG15’-UTR c.-53G>C, c.-23A>G和c.-18G>T总变异,MUTYH AluYb8插入(AluYb8MUTYH, rs10527342)变异,并且研究了这些变异及其联合作用与中国人群T2DM发病风险的关系。二、方法1.利用HRM方法筛查T2DM病人和正常对照人群DNA样本中hMTH1c.247G>A变异,hOGG1基因5’-UTR区c.-53G>C, c.-23A>G和c.-18G>T多态性变异的基因型。2.直接测序法测定HRM筛查出的hOGG1基因5’-UTR区c.-53G>C, c.-23A>G和c.-18G>T变异的杂合型样本的多态性位点基因型。3.凝胶电泳法对T2DM病人和正常对照人群DNA样本中AluYb8MUTYH变异基因型进行分型。三、结果1. hMTH1c.247G>A变异增加了大于55岁年龄组中国人群的T2DM发病风险(OR=1.579;95%CI:1.029-2.421)。2. hOGGI5’-UTR区c.-53G>C, c.-23A>G和c.-18G>T的总变异与中国人群的T2DM发病风险相关(OR=1.507,95%CI:1.122-2.024)。3. AluYb8MUTYH变异与中国人群的T2DM发病风险相关(OR=1.229,95%CI:1.030-1.466)。4.联合作用分析发现,hMTH1c.247G>A与AluYb8MUTYH在增加T2DM发病风险方面存在协同效应(OR=1.635;95%CI:1.147-2.330);并且hOGG15’-UTR区总变异联合AluYb8MUTYH也可协同提高T2DM的发病风险(OR=1.804;95%CI:1.254-2.595)。四、结论:hMTH1, hOGG1, MUTYH基因多态性变异与中国人群的T2DM发病风险密切相关。本实验结果首次阐述AluYb8MUTYH变异与hMTH1c.247G>A或hOGG15’-UTR区总变异在引起中国人群T2DM发病风险增高中存在协同关系。
其他文献
目的建立测定小鼠血浆中白藜芦醇的高效液相色谱法,并研究白藜芦醇在小鼠体内的药动学。方法色谱柱为C18柱(150mm&#215;4.6mm,5μm),流动相乙腈-水(32:68),流速为1.0mL&#183;min^-1,检测
目的观察降酶方对药物性肝炎的疗效。方法将50例门诊药物性肝炎患者随机分为对照组20例和治疗组30例,对照组给予多烯磷脂酰胆碱胶囊口服,456 mg,tid,20 d;治疗组治疗同对照组
1984年,国家批准建立了大连、青岛等14个经济技术开发区,由此掀开了全国建立发展开发区的热潮.开发区设立之初,一般是在城市划定小块的区域, 其主要任务是招商引资、兴办项目
目的研究分析心脏死亡捐献供肾肾移植患者术后DGF的护理干预效果。方法随机选取2017年1月至2018年12月我院收治的心脏死亡捐献供肾肾移植患者80例,将其平均分为两组,研究组40
背景海洛因成瘾人群是我国艾滋病传播的主要高危人群之一。美沙酮维持治疗(MMT)对预防海洛因成瘾人群中艾滋病的传播效果明显。我国开展社区MMT7年多来,参加MMT海洛因成瘾者
背景:系统性红斑狼疮(Systemic Lupus Erythematosus, SLE)是一种常见的自身免疫病,异基因间充质干细胞(mesenchymal stem cells, MSCs)移植治疗难治性SLE是一项新技术。我们
随着国家和社会的发展,人们对生态环境越发重视。在经济发展的过程中,因采矿而遗留下了大量的废弃矿坑,这些矿坑的治理迫在眉睫。飘台作为一种治理高陡光滑岩壁的有效方法,在
目的分析讨论绞窄性肠梗阻术前术后术后的护理。方法对患者进行术前抢救护理,术前护理、术中护理、术后护理及健康指导,对患者的临床治疗效果进行观察。结果经治疗和护理后,
近年来,江苏省无锡蠡园经济开发区始终坚持以更高站位、更严标准和更硬举措推进生态文明建设,取得了阶段性成效。生态环境持续向好,河道全部消劣,其中3条建成“样板河道”,“