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茉莉是我国一种重要的经济作物,田间病害多种多样,极大的影响了茉莉的产量和质量,尤其对茉莉病毒病的研究还不深入,很多病害的致病因子不明确,导致病害预防缺少理论依据,无的放矢。因此,对茉莉病毒病病原的鉴定和致病机制研究对于病害的预防控制具有重要意义。首先,采集疑似病毒病茉莉样品,利用小RNA深度测序和生物信息学发现了一种侵染茉莉的新的番茄丛矮病毒科病毒(Tombusviridae),命名为茉莉H病毒(Jasmine virus H,JaVH)。茉莉H病毒(GenBank accession number KX897157)的基因组序列与番茄丛矮病毒科不同属病毒的相似性在41.48%-58.43%,与天竺葵环斑病毒属(Pelarspovirus)的相似度最高。与该属各病毒相比,发现茉莉H病毒复制酶和外壳蛋白的氨基酸序列与玫瑰叶畸形病毒(Rosa rugose leaf distortion virus,RrLDV)的相似度最高,分别为58.36%和52.80%,两个运动蛋白的氨基酸序列与玫瑰黄叶病毒(Rose yellow leaf virus,RYLV)的相似度最高,分别为58.08%和63.53%,远低于成立该属新成员的标准,因此我们认为茉莉H病毒是天竺葵环斑病毒属的一个新成员。其次,构建了茉莉H病毒福建分离物的侵染性cDNA克隆,通过多种分子生物学手段验证其可系统性侵染本生烟,这为研究病毒基因功能以及致病机制奠定了基础。再者,为了明确该病毒在中国各茉莉产区的发生及变异情况,本研究收集了广西、广东、湖南、江苏、吉林、山东、四川和云南8个省的茉莉样品,经检测发现各样品均携带该病毒。克隆JaVH各省分离物,比较分析核苷酸和氨基酸序列,发现相似性较高。经深入分析发现福建和吉林分离物全基因组核苷酸相似性高达99%,所编码的氨基酸仅一个不同,但它们的3’UTR的序列相差极大。进一步研究表明3’UTR的差异极大地影响了病毒侵染过程,福建分离物的3’UTR更有利于病毒的侵染;结合RNA二级结构的预测,我们认为病毒可能通过3’-5’的互作来促进病毒的复制或是翻译。最后,本研究通过农杆菌共浸润瞬时表达系统明确了茉莉H病毒的外壳蛋白具有较强的RNA沉默抑制子的功能,并通过构建突变体鉴定了多个影响抑制子功能的氨基酸位点。