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目的：探讨新疆地区维吾尔族与汉族乙型肝炎病毒耐药基因型分布及耐药变异状况；方法：采用DNA微阵列芯片对来自维族、汉族人群的乙型肝炎患者血清标本1028例进行与HBV耐药相关的rt L180M，rtM204I，rtM204V，rtA181T，rtA181V和rtN236T的四个耐药突变位点6中突变在汉族与维吾尔族中的分布特征，探讨新疆乌鲁木齐地区乙型肝炎耐药基因位点的分布情况，比较汉族与维吾尔族乙肝耐药的差异；结果：维吾尔族与汉族的乙型肝炎病毒天然耐药突变率分别为：2.17%、16.36%，维吾尔族低于汉族，差异有统计学意义(χ2=5.6539,P＜0.05)；维吾尔族与汉族慢性乙肝患者经核苷（酸）类似物抗病毒治疗后的耐药突变率分别为：53.26%、59.28%，差异无统计学意义(χ2=1.2389, P＞0.05)；rtL180M在维吾尔族与汉族中的突变率分别为：27.17%、32.22%，差异无统计学意义(χ2=0.9726, P＞0.05)；rtM204I/V在维吾尔族与汉族中的突变率分别为：34.78%、40.48%，差异无统计学意义(χ2=1.1213, P＞0.05)；rtA181T/V在维吾尔族与汉族中的突变率分别为13.04%、31.74%，维吾尔族低于汉族，且差异有统计学意义(χ2=13.8204, P＜0.05)；rtN236T在维吾尔族与汉族中的突变率分别为19.57%、23.83%，差异无统计学意义(χ2=0.8416, P＞0.05)；结论：维吾尔族乙型肝炎病毒对核苷类似物的天然耐药率低于汉族。但两个民族的慢性乙肝患者在抗病毒治疗后的耐药突变中不存在差异，四个突变位点的6种突变中，只有rtA181T/V在两个民族之间有差异，且维吾尔族低于汉族，其他的3个位点的4种突变在两个民族中无差异，rt L180M、rtM204I/V、rtN236仍是维吾尔族乙型肝炎病毒耐药的常见变异。