为了推动产业结构调整、促进经济健康平稳发展,我国不断深化科技体制改革。在市场引导、政策扶持的配合下,高新技术企业发展迅速并创造了新的经济增长点,推动了我国产业结构的优化升级。但目前我国高新技术企业发展仍然存在缺口,其中高新技术企业大多为中小型企业,在具有重要意义的研究与开发的内部控制上仍存在不完善的地方。研究与开发内部控制建设是否完善、执行是否有效,将直接影响企业的研发效率和企业的创新能力,进而影响企业的核心竞争力,识别和解决研究与开发内部控制的缺陷成为高新技术企业持续发展的关键。目前,国内对研究与开发内部控制的研究大多停留在理论阶段,缺乏深入的案例分析,本文在具体案例和数据基础上,分析研究与开发内部控制存在的主要问题,提出比以往研究更加具体有效的解决对策。本文通过A科技公司的案例研究,根据《企业内部控制应用指引第10号——研究与开发》对研究与开发内部控制风险点的解释,利用实地调研法和案例研究法,从研发流程和内部控制要素的角度,分析A科技公司研究与开发内部控制问题。针对存在的问题,从不同角度提出内部控制解决对策,包括改善企业内部环境、健全风险评估方案、提高控制活动有效性、促进部门之间信息传递与沟通、健全研发活动监督与评价体系,以此为行业内更多高新技术企业改善自身研究与开发内部控制提供思路和方法。