以论文合著形式所表现的科研合作是学者之间合作的重要形式,而论文合著所包含的不止是微观层面上的学者间的合作,也是中观层面上的机构间合作,更是宏观层面上的国际合作,而对于论文合著的研究从出发点来看有从学科或某领域切入的论文合著研究,也有从机构切入的论文合著研究,还有从作者切入的论文合著研究,但无论以何种角度切入进行论文合著研究,其目的都在于通过对论文合著现状的分析来了解目前无论是学者还是机构或者区域的在某一角度的发展状况,其意义更在于在了解现状的同时对未来更好的发展提出建议。本文将以植物与动物科学作为切入点,并以我国在植物与动物科学拥有较高水平即进入ESI前1%的4所省级农科院为研究对象进行论文合著的研究。首先通过文献分析法对4所省级农科院的自身发展状况包括学科生产力、学科影响力、学科发展力进行分析了解自身发展现状;其次通过统计分析法,从国家、区域、机构这三个维度进行多角度论文合著分析,以了解4所高水平省级农科院在论文合著上存在的差异;最后通过社会网络分析法通过整合4所省级农科院的合著机构得到129所合著机构,并分析这129所合著机构所形成的合著网络,了解其合著的网络的特性,并从4所省级农科院、129所合著机构代表的全国、全球这三个维度进行研究热点以及基于共词网络指标的对比分析。通过不同分析方法的多角度分析,更好的了解我国高水平省级农科院的论文合著现状,4省级农科院的自身发展中北京农林科学院发展势头强劲且论文质量最高,而浙江省农科院步较高,但近几年发展速度明显回落,而江苏省农科院虽然发文数量高,但发文质量有待提升,山东省农科院无论是发文数量还是发文质量均排名较靠后,相比其他三院劣势明显;就合著情况来看北京院国际化程度最高其余三院略显不足,而合著区域上,华东区域优势明显占比最大,华北区域紧随其后,其它区域影响力相对较小,各农科院与所在省市内顶尖农业高校合著联系显著,而129所合著机构形成的合著网络中地域一致性显著,华东、华北区域优势明显;就四省级农科院的共词网络来看其研究热点与全国的研究热点基本吻合,而与全球的研究热点吻合度相较于全国有所下降,这也是由于我国以及区域间发展特色所造成,即我国作为农业大国的国情以及省级农科院所处的地理位置,对于共词网络所形成的社区研究主题而言,省级农科院呈现出了较大跳跃性,而全国则呈现出相对的主题研究稳定性,这也是由于四省级农科院的长效研究机制不够完善,而对于共词网络指标来看由于三个层级的样本量不同导致,省级农科院的各项共词网络指标均呈现波动,而全国的共词网络指标则呈现出正向增长的态势,全球的共词网络由于样本量够大所以波动较小且发展较为稳定。