在以往的司法实践中，常常出现贪污贿赂、恐怖活动犯罪案件的犯罪嫌疑人、被告人逃匿或者死亡后，其违法所得无法追缴的法律障碍问题。违法所得是行为人通过法律禁止的手段获取的具有经济价值的物质实体，即赃款、赃物，这些财产往往是犯罪所得，违法所得的对立物是合法财产。因此，对这些财产的追缴必须通过刑事诉讼程序。我国2012年修订后的《刑事诉讼法》第五编新增了“特别程序”。其中第三章为“犯罪嫌疑人、被告人逃匿、死亡案件违法所得的没收程序”，共规定了4个条文。作为本次刑事诉讼法修正新增的一项特别程序，违法所得没收程序解决了犯罪嫌疑人、被告人不到案，无法通过正常的刑事司法渠道追缴其违法所得的问题。但鉴于程序还处在初生阶段，有很多问题需要厘清，因而需要从理论和实践层面进一步探讨、修正、完善。本文共分以下为三章：第一章违法所得没收程序概述该部分为理论铺垫，主要阐述了违法所得没收程序的相关概念、特点、性质以及设置违法所得没收程序的意义。第二章违法所得没收程序的适用原则和适用条件本部分开始阐述新修订的《刑事诉讼法》之违法所得特别程序适用方面的具体内容。理论研究与实际操作并存。分析了适用原则和适用条件。第三章违法所得没收程序的运行本部分作为本文的核心内容，对违法所得没收程序的运行机制进行细化，主要包括违法所得没收程序的启动、审理、裁判和救济四方面。