在竞争越来越激烈的市场经济环境中，市场和行业的分工日趋细化，物流管理和服务的需求也在不断延伸。人们开始意识到，单纯地把物流环节外包给第三方物流公司已经无法满足降低供应链运作成本的需求，毕竟现在企业的竞争是供应链对供应链的竞争，而成本历来就是竞争中最重要的因素之一。在物流系统中，物流中心发挥着巨大的作用，而其中物流中心的选址又是对物流中心的运营有着战略性的重要性。文章选取第三方物流S物流公司作为研究对象，通过对其一个顾客的物流需求分析，以及物流业务的流程分析，确定了采用保税仓库的方进行业务流程优化。进而根据顾客的物流需求特点，确定了采用层次分析法进行保税仓库选址问题的求解。接着，论文确定了保税仓库选址中的层次化结构评价模型，并确定了各个指标的优劣性排序，以及各个备选方案针对各个指标的优劣性排序。最后，将层次分析法决策结果应用到实际之中，验证了最佳备选方案的实施效果。