自由现金流量概念自被提出以来已有几十年的历史,它在公司价值评估中有举足轻重的作用,能全面反映公司经营业绩并评上市公司的长期发展潜力。但由于自由现金流量预测法较之现有的其他方法的复杂性以及假设要求的严格性,其在财务理论方面的运用和实证研究还较少。本文旨在从分析自由现金流量理论入手,以客观的财务数据为基础,利用自由现金流量贴现模型对农业上市公司价值进行评估进行研究。本文通过回顾国内外企业价值评估理论和评估方法的研究文献,认为现金流量贴现法是目前企业价值评估中理论基础最为坚实的一种方法。而自由现金流指标与其他现金流指标相比,避免利润操纵、指标更为客观、更综合的考虑了企业整体运营状况等优势。由此,本文在自由现金流量贴现法评估企业价值理论基础上,按照标准选择了12家农业上市公司为样本,以实际会计报表数据与市场表现情况对样本公司的公司价值进行了评估。研究结果表明：(1)企业内在价值与流通市值的不匹配原因在于农业上市公司股本规模过小；(2)农业上市公司经营状况欠佳也是公司价值偏低的原因；(3)本文选取经营状况较好的企业对其进一步实证研究,结果表明在该情况下股权自由现金流量贴现模型对于市场价值的预测有较好的实用性。对于农业上市公司企业价值评估结果所反映出来的问题,提出了有针对性的对策建议：(1)建立成熟而有效的市场机制；(2)健全完善的法律制度；(3)树立以企业价值最大化为导向的理念；(4)强化现金流控制管理；(5)优化流动资产管理。