突变bfr1基因提高酿酒酵母抗咖啡碱菌株的筛选与鉴定

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通过基因工程技术,可以人为地改变天然蛋白质某些性质,增强它们对不良环境的适应,创造出天然蛋白不具备的某些优良特性甚至表现出新的活性,即在分子水平上,对特定的基因或蛋白质进行定向进化。裂殖酵母ABC(ATP-BindingCassette)转运蛋白家族中的bfr1(brefeldinAresistance)是多向耐药亚族的一员,是细胞中多种抗生素的外排泵,能够将咖啡碱跨膜运输到胞外。本文利用易错PCR技术对bfr1基因进行随机突变,构建突变文库,真核表达,以及对耐受咖啡碱的酿酒酵母菌株的筛选鉴定等研究,取得以下主要结果:   (1)应用Gateway技术,BP反应得到bfr1基因的入门克隆pENTR-bfr1;选用大肠杆菌-酵母穿梭表达载体pAG413-GPD-ccdB,LR反应构建bfr1酵母表达载体pAG413-bfr1,在酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)INVSc1菌株中表达。以野生型INVSc1菌株为对照,考察不同浓度的咖啡碱对转化酵母菌株的生长影响。结果表明,随着咖啡碱浓度的升高,酵母菌生长受到的抑制越来越强烈,在含8mg/mL咖啡碱的培养基中,野生型酵母几乎不生长,而转化bfr1基因的菌株生长缓慢,受到咖啡碱的抑制减弱。   (2)通过易错PCR技术,选择预期得到2.7bp/1000bp突变率的反应条件,对质粒pENTR-bfr1上bfr1基因进行随机突变,将PCR产物与酵母表达载体pAG413-GPD-ccdB连接,获得随机突变质粒pAG413-bfr1,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,构建了原始库容为106的bfr1随机突变文库。   (3)将bfr1随机突变文库转化酿酒酵母INVSc1,培养在分别添加10、15mg/ml咖啡碱的SD-His培养基中。经过大量筛选,最终得到INVSc1突变株pAG413-bfr1-B,能够耐受10mg/mL的咖啡碱。对该突变株测序,比对分析,全长DNA序列有13个碱基突变,突变率为0.28%,其中有10个碱基转换,3个碱基颠换。除去第829位和1198位氨基酸发生同义突变,全bfr1分子有11个氨基酸突变,突变率为0.72%。   (4)利用定点突变进一步确定有益突变。突变株pAG413-bfr1-B的突变位点及蛋白结构分析为定点突变的理性设计奠定基础。根据突变位点序列,设计三对寡核苷酸突变引物,使用NlEBPhusion高保真DNA聚合酶,通过PCR反应将突变引入pAG413-bfr1中,产生S36(site1)、D340(site2)、Y497(site3)三种定点突变。然后用DpnI酶切PCR产物除去模板DNA,取适量酶切产物转化大肠杆菌超级感受态细胞XL1-Blue,随机挑选转化子进行测序,结果表明三个单位点都发生了突变,突变率达到100%。经过筛选鉴定,得到能耐受10mg/mL的咖啡碱突变株site-mut2,说明bfr1编码的第340位密码子由天冬氨酸(GAC)残基变为甘氨酸(GGC)残基,增强了bfr1蛋白对咖啡碱的外排,提高了酿酒酵母对咖啡碱的抗性。
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