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目的：探讨贵州省神经管畸形(neural tube defects, NTDs)高发的可疑危险因素,研究母亲脂联素基因(APM1)、脂肪酸结合蛋白2基因(FABP2)(?)偶联蛋白2(uncoupling proteins-2, UCP2)基因多态性与子代NTDs发生风险间的关系,从而揭示多因素在NTDs发生中的作用。方法：采用1：1匹配的病例对照研究,选取2010年10月至2012年2月间在贵州省8个地区(州)的17所医院生育NTDs患儿或B超诊断为NTDs患儿而引产的母亲63例组成病例组,选取同期生育正常儿的母亲或与病例组妇女孕周相近的孕妇63名组成对照组。对两组研究对象进行问卷调查,采集每例研究对象肘静脉血5m1,提取DNA,-40℃保存备用；采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测二组研究对象脂联素基因APM1外显子2第45位点T/G, FABP254密码子A-G突变和UCP2基因第4外显子的55位点多态性。数据分析运用SPSS16.0软件,采用Logistic回归模型,对APM1、 FABP2、UCP2基因及其他调查因素进行单因素及多因素分析,筛选贵州省NTDs发生的影响因素。结果：APM1基因第2外显子有3种基因型：TT(野生型)、TG(杂合子型)和GG(纯合子突变型),病例组基因频率分别为39.7%、42.9%和17.5%；对照组为55.6%、31.7%、12.7%。两组间比较不具有统计学意义(χ=3.18、P>0.05)。等位基因T、G频率分布在病例为61.1%、38.9%；对照组61.4%、38.6%,两组间比较不具有统计学意义(χ=3.00、P>0.05)FABP254密码子A-T突变分为野生型A/A和变异型A/T、T/T,基因型频率在病例组分布为33.3%、50.8%、15.9%；对照组为55.6%、39.7%、4.8%两组具有统计学意义(χ=8.13,P<0.05),等位基因A、T频率分布在病例组为58.7%、41.3%；在对照组为75.4%、24.6%。两组间比较具有统计学意义(χ=7.92,P=0.05)UCP2基因第4外显子的55位点的基因频率在病例组和对照组的比较：UCP2基因位点有3种基因型,即野生型AA、杂合突变型AV和纯合突变型VV。基因频率分布病例组为42.9%、44.4%、12.8%；对照组为50.8%、38.1%、11.1%。两组间比较不具有具有统计学意义(χ=0.79、P>0.05),等位基A、T因频率分布在病例组为65.1%、34.9%；对照组为69.8%、30.2%,两组间比较不具有统计学意义(χ=0.65、P>0.05)。将单因素条件logistic回归分析有统计学意义的变量5项引入多因素条件logistic回归分析,最终进入模型的变量有4项,分别为妊娠剧吐、食用发芽土豆、被动吸烟和FABP2基因,OR及其95%C1分别为3.56(1.17-10.87)、3.36(1.17-9.71)、5.80(1.17-28.78)、2.41(1.13-5.13)。交互作用分析结果显示：IFABP254密码子基因多态与妊娠剧吐和食用发芽土豆间存在交互作用,交互作用超额相对危险度RERI分别为1.81和11.6,交互作用指数S分别为1.80和3.57,交互作用归因比API分别为0.36和0.67。结论：FABP254密码子基因多态性可能与NTDs的发生有关,APM1基因第2外显子T45G. UCP2基因55位点突变未见与NTDs发生有关。影响贵州省NTDs发生的主要危险因素为母亲妊娠剧吐史、食用发芽土豆和被动吸烟。