我国先后发布了《企业内部控制基本规范》及《应用指引》，将“工程项目控制”纳入到我国内部控制体系中，但是无论是理论界还是实务界对于工程项目风险及内部控制研究存在严重的缺失，而这种缺失严重影响了内部控制总目标的实现，最终影响企业价值的实现。本文采用规范研究、归纳法与演绎法、专家咨询与调查法，综合运用管理学理论、工程学理论、风险管理及内部控制理论，以国有企业工程项目为主题，围绕国有企业工程项目风险管理及内部控制设计展开研究。本文针对这个问题做了以下探讨：在对风险管理和内部控制相关理论和政策的梳理回顾后，结合前人的研究成果，本文认为国有企业具有其特殊的内部控制环境，其中存在的内部控制环境问题，可能会成为其各项业务活动风险的来源，当然包括工程项目这一重要的业务活动。基于这一观点，本文展开分析研究，发现国有企业法人治理结构、组织机构设置和权责分配方面的问题，可能会成为工程项目中各阶段授权审批这部分的风险来源；内部审计机构设置不合理，对工程项目内部控制的执行未进行有效监督，可能会导致风险未能在事前有效的加以控制；人力资源配备不合理，将成为工程项目各个关键节点重大风险的来源，这是需要从招聘到岗位任用、绩效考评各个环节重点控制的等。在此研究结论基础上，本文引用风险导向下的内部控制思想，从宏观上提出针对国有企业内部控制环境问题的政策建议，又从微观上设计针对工程项目各风险点的内部控制措施，希望能对国有企业工程项目的管理提供直接有效的指导。