【摘 要】
:
蛋白稳态失衡是衰老和许多疾病发生的内在因素之一,目前已知热胁迫反应与衰老和蛋白稳态直接相关。作为分子伴侣,热胁迫蛋白可以调节其它蛋白质的折叠、组装、运输和降解,从而维持细胞的蛋白稳态。秀丽隐杆线虫具有生命周期短、衰老特征明显、与人类基因同源性高等优势,已成为衰老和蛋白稳态研究的重要模型。本文以秀丽隐杆线虫为模型,以热胁迫存活率为筛选指标,通过饲喂海参(仿刺参)cDNA文库表达菌直接筛选具有抗热胁迫
论文部分内容阅读
蛋白稳态失衡是衰老和许多疾病发生的内在因素之一,目前已知热胁迫反应与衰老和蛋白稳态直接相关。作为分子伴侣,热胁迫蛋白可以调节其它蛋白质的折叠、组装、运输和降解,从而维持细胞的蛋白稳态。秀丽隐杆线虫具有生命周期短、衰老特征明显、与人类基因同源性高等优势,已成为衰老和蛋白稳态研究的重要模型。本文以秀丽隐杆线虫为模型,以热胁迫存活率为筛选指标,通过饲喂海参(仿刺参)cDNA文库表达菌直接筛选具有抗热胁迫活性的菌株,经测序得到基因序列后通过生物信息学分析预测潜在抗热胁迫蛋白的结构、性质和功能。主要结果如下:1.秀丽隐杆线虫群体在热胁迫条件下高中低存活率的确定。为了准确筛选文库表达菌对秀丽隐杆线虫热胁迫存活的保护作用,本文首先选择以大肠杆菌OP50为食的秀丽隐杆线虫对热胁迫(35℃)时间和热胁迫后的恢复(20℃)时间进行研究,确定了对应于高、中、低存活率(75%、50%和25%)的热胁迫时间和恢复时间。经实验发现,当热胁迫时间为16 h时,秀丽隐杆线虫的存活率为60%左右,对应于中、低存活率,因此选择该热胁迫时间开展后续实验。在实验中我们还发现,热胁迫后的秀丽隐杆线虫会进入“休眠”状态,需要一定时间来恢复其活动状态,通过比较最终确定12 h的恢复时间来进行后续实验。2.海参cDNA文库表达宿主菌对秀丽隐杆线虫生长与热胁迫存活的影响。作为食物,不同菌株对秀丽隐杆线虫的生长发育和胁迫反应可能有不同影响,因此我们以常用食物大肠杆菌OP50和NA22为对照,检测了海参cDNA文库表达宿主菌BL21(DE)plys S对秀丽隐杆线虫的影响。食物清除率和热胁迫存活实验结果表明,该宿主菌对秀丽隐杆线虫的生长和热胁迫存活率没有影响,因此后续筛选实验可以用宿主菌本身作对照。此外,细菌生长速率不同可能产生饮食限制等潜在影响,因此我们对文库表达菌与对照宿主菌的生长速率也进行了比较,发现它们的生长速率差异不大,进一步说明宿主菌可用于后续热胁迫对照实验。3.海参cDNA文库抗热胁迫蛋白表达菌株的筛选。我们先将海参cDNA文库表达菌饲喂秀丽隐杆线虫,然后根据上述实验条件检测文库表达菌对秀丽隐杆线虫热胁迫存活率的影响,以此筛选具有抗热胁迫活性的候选文库菌。从94个文库菌株中经初步筛选得到53个具有抗热胁迫潜在活性的菌株,经过进一步筛选和验证,获得16个具有抗热胁迫活性的阳性克隆作为候选菌株。通过斑点印迹法对候选菌株的蛋白质表达进行鉴定,发现这些阳性克隆均有相应蛋白质的表达。4.抗热胁迫海参蛋白候选表达菌株的基因测序与比对分析。从上述阳性克隆中我们选择了12个文库候选菌进行测序,获得相应的基因序列。然后利用BLAST比对工具,以blastx进行序列分析,限定物种为仿刺参,主要参考Max Score和E-value两个值选择比对结果中相似性最高的序列,同时还参考Identities和Gaps值对blastx结果进行选择。通过这些分析,发现有6个基因序列可以找到相应的海参蛋白质信息。5.抗热胁迫海参蛋白的结构、理化性质和功能预测与分析。为进一步了解潜在抗热胁迫海参蛋白的特性与功能,我们根据上述基因与蛋白信息进行了结构、理化性质和功能的预测与分析。首先通过blastx比对得到抗热胁迫海参蛋白的一级结构,然后通过PSIPRED Work Bench和SWISS-MODEL对一级结构进行分析,预测得到其二级结构和三级结构。在此基础上,利用Prot Param软件对潜在抗热胁迫海参蛋白的理化性质进行了预测和分析,获得相应蛋白质的半衰期、等电点、不稳定系数等理化性质参考信息。最后通过BIOPEP-UWM软件和Peptide Ranker在线工具进行了活性预测与分析,发现部分蛋白及其肽段具有潜在的抗氧化活性。综上所述,本文首先确定了秀丽隐杆线虫热胁迫存活实验条件,然后以海参cDNA文库表达宿主菌BL21为对照,筛选得到具有潜在抗热胁迫活性的海参蛋白表达候选菌株,并通过测序得到潜在活性蛋白的基因序列。在此基础上,通过生物信息学方法预测并分析了抗热胁迫蛋白的结构、理化性质和生物功能,为海参蛋白的后续研究和开发提供了基础。同时,本文在整体动物水平上通过饲喂表达菌株直接筛选抗热胁迫蛋白的方法为其它活性蛋白的高效筛选提供了借鉴模式。
其他文献
目的:回顾我院ICU老年住院患者压疮发生的特点,探讨血管加压剂对ICU老年住院患者压疮的影响及导致压疮发生的危险因素,从而为有效预防压疮,遏制压疮的进展提供相关理论依据。方法:通过查阅医院管理信息系统(Hospital Information System,HIS)和压疮不良事件上报系统,对2017年1月-2019年12月在河北省某三级甲等医院重症监护病房(Intensive care unit,
目的:探讨心脏外科手术患者术前身体活动能力(握力、步行速度和计时起立-行走测试)与术后谵妄之间的关系。为心脏外科手术患者术后谵妄的发生提供新的预测指标。方法:本研究选取2019年9月至2020年11月在天津市某三级甲等心血管专科医院进行心脏外科手术的患者作为研究对象。采用医院信息系统收集研究对象的一般资料和围术期资料;应用身体活动能力评估工具,客观测量握力、步行速度和计时起立-行走测试三项指标,分
目的:本研究应用NRS2002对河北省6所三级甲等医院肾内科的持续非卧床腹膜透析患者进行营养风险筛查。了解患者营养风险的现状,并对影响患者营养风险的相关因素进行分析,为临床干预提供科学依据,从而有针对性的采取相应措施,进而减少患者营养风险的发生,改善患者的临床结局。方法:采用整群随机抽样法,选取2019年10月至2020年10月河北省6所三级甲等综合医院肾内科的持续非卧床腹膜透析患者524例,由经
目的:调查腰椎退行性疾病患者疼痛信念、负性情绪与生活质量的现状并分析三者之间的关系;探讨影响患者生活质量的因素,以期为优化患者生活质量提供理论依据。方法:采取便利抽样的方法,选取2019年9月至2020年1月期间承德市某两所三甲医院骨科住院待手术的340名腰椎退行性疾病患者为研究对象。使用一般资料调查表、疼痛信念与感知量表(PBPI)、医院焦虑抑郁测量表(HADS)、脊椎退行性疾病患者生命质量量表
目的:探索pH 2.0~3.0和pH 6.0~7.0的酸性氧化电位水(EOW)对胃肠道手术患者进行术前口腔护理的干预效果,为EOW后续在临床口腔护理的应用提供参考依据。方法:采用临床随机对照研究方法,选取在2019年12月至2020年10月河北省某三甲综合医院胃肠外科进行胃肠道手术的患者为研究对象。随机数字表法分为试验A组、试验B组和对照组。试验A组给予pH 2.0~3.0的EOW,试验B组给予p
目的:本研究调查产褥期妇女社会支持、育儿胜任感与生活质量的现状,明确产褥期妇女生活质量的影响因素,分析产褥期妇女社会支持、育儿胜任感与生活质量的相关性,为提高产褥期妇女的生活质量提供理论依据。方法:采用便利抽样法,于2019年10月~2020年1月在承德市某三级甲等综合性医院产科门诊复查的产后4~6周产褥期妇女作为研究对象,采用一般资料调查表、社会支持评定量表、中文版育儿胜任感量表和世界卫生组织生
目的:以柯卡芭舒适理论为指导,调查冠心病监护病房PCI术后患者舒适状况,分析其影响因素,初步构建并实施舒适护理干预方案,以提高患者舒适度,促进其康复。方法:1.采取便利抽样的方法,于2019年10月~2019年12月期间,在河北省四家三级甲等医院,选择冠心病监护病房接受PCI手术的患者400例为研究对象,应用舒适状况量表,对其舒适状况及影响因素进行调查与分析,有效回收量表386份。2.利用单纯随机
全世界范围内,在众多恶性肿瘤中肺癌具有最高的发病率和死亡率,其中非小细胞肺癌占比约85%,是肺癌的常见类型。非小细胞肺癌具有很强的个体差异性和异质性,恶性程度较高,预后差,通过传统常规的诊断手段难以满足临床的需求,而且具有侵入性、耗时费力、价格昂贵、患者依从性差等不足,因此需要一种使用简便快捷、微创或无创、取样方便和准确性高的方法提升临床诊断性能。血浆中含有人体内大量的、比较全面的蛋白质种类,能够
目的:探讨互动式患者参与在全膝关节置换(Total Knee Arthroplasty,TKA)患者术后康复中的应用研究。旨在为TKA患者术后的院内院外护理提供指导意义,同时为未来开展TKA术后康复护理提供理论和实践参考依据。方法:选择2019年12月至2020年5月在河北省某市某三级甲等医院骨科病区行TKA的患者作为研究对象。严格按照纳排标准筛选,最终纳入符合要求的研究对象70例。将研究对象在入
众所周知,大米作为谷物是加纳消费最多的主食之一。毫无疑问,这使稻米种植业得到了发展,就此而言,稻米业更有利于在该国创造农村和城市就业机会。充满活力和高效的稻米产业也将有助于大大减少该国的进口费用;考虑到该国每年在大米进口上的花费,这是不容小觑的。但是,该国大量涌入的进口大米正在阻碍甚至是扼杀国内这一有前途的稻米产业,并且使大米市场更加复杂。基于此,加纳国内的消费者对所购买大米的质量要求也越来越高,