定量PCR技术在环境水体病原细菌检测中的应用研究

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为了研究实时荧光定量聚合酶链式反应技术(QPCR)在环境水体病原细菌检测中的应用价值,分别设计并合成志贺氏菌(Shigella sp.)、沙门氏菌(Salmonella typhi)、大肠埃希氏菌(Escherichia coli.)、霍乱弧菌(Vibrio cholerae)四种病原细菌的特异性引物,建立肠道病原细菌定量PCR检测方法。同时,应用QPCR检测方法对西安市五处环境水体即西安市饮用水源水(黑河)、纳污河水(沪河)、城市景观水(大唐芙蓉园北湖和兴庆湖)以及污水厂二级出水(北石桥污水净化中心)中病原细菌的细胞密度进行4个月的连续检测,并将检测结果进行比较分析,结果显示:本研究建立的QPCR检测方法能够对四种目标菌株进行特异性检测,QPCR检测的灵敏度为4.56CFU/μL。该方法可将DNA提取、PCR定量分析控制在5小时内完成,充分展示了该法快速灵敏的特点。对西安市环境水体的QPCR检测结果表明,五个水体中都没有检测到霍乱弧菌,这说明该病原细菌通常情况下在西安市地表水体中不存在。几种主要致病菌中,大肠埃希氏菌从各种水体检出的频度最高,且在水体受到一定污染后即持续检出(大唐芙蓉园北湖和兴庆湖),对于污染严重的水体(浐河、北石桥污水净化中心),大肠埃希氏菌成为水中肠道感染细菌群的主体,其强度接近于用通用引物检测出的总细菌强度;同时,沙门氏菌和志贺氏菌也持续被检出,虽然其强度远低于大肠埃希氏菌,但可以认为是水污染的标志之一。在五个水体中,北石桥二级出水病原菌污染最严重,各病原细菌指标均为最高值。然后依次为浐河、兴庆湖、北湖,黑河水源水受污染最小。本研究提出的QPCR方法可用于检测环境水体中的病原细菌,对于传统的检测方法是有力的补充。随着该技术的进一步完善,其必将在环境微生物领域发挥越来越重要的作用。
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