随着高等教育对办学效率的不断追求,完善大学治理成为了当今高等教育领域的重大课题。大学的治理不仅会受到大学自身发展变化的影响,同时也受到国际环境和国家政治、经济与社会发展变化的影响。21世纪初日本国立大学的法人化改革就是为了适应国家政治、经济、社会的发展变化,在政府的推动下进行的。国立大学法人化改革使国立大学由国家行政机构转变为独立的行政法人。作为独立的行政法人,日本国立大学取得办学自主权,在大学的教育研究及经营方面都拥有自治的权力,但是也要承担更大的责任。提高国立大学办学水平,增强竞争力,是国立大学改革后一直追求的目标。大学的内部治理是大学运转的核心,科学合理的内部治理结构是大学发展的重要保障,而日本国立大学改革前大学内部的官僚制,造成了大学内部平均主义盛行、教育资源浪费、决策效率低下等问题,严重阻碍了国立大学的发展。因此,国立大学内部治理改革的重点就是建立科学的治理结构,实现大学的专业化管理,提高大学的办学水平。本文从国立大学改革之前内部治理所面临的困境出发,主要对国立大学改革的内容进行分析,包括国立大学内部治理理念的革新、国立大学章程的修订、改革前后内部组织结构的变化、各治理主体之间权责的重新分配、新的国立大学法人运行机制五个方面。然后,通过大量的事实资料对国立大学改革的成效及改革过程中出现的新问题进行分析,并根据日本文部科学省近几年颁布的有关推动国立大学发展的政策文件,分析国立大学法人内部治理的未来发展方向。最后,结合我国大学内部治理存在的问题,提出几点完善我国大学内部治理的建议。我国在1998年颁布的《高等教育法》中就赋予了大学法人的资格,但是我国的大学并没有像日本国立大学那样从政府行政机构中彻底的分离出来,大学的法人地位不够明确,导致我国大学内部治理中出现严重的泛行政化,各组织机构责权不明确,学术权力缺失等问题。无论大学如何改革,大学作为教育学术机构的性质是永远不会改变的,大学的内部治理要以尊重学术自由为前提,这一点在日本国立大学的章程中再次被强化。日本国立大学在尊重学术自由基础上实行教育与经营相分离的治理结构,加强民主管理的外部参与办学机制等一系列改革措施都值得我们借鉴。