政府资助R&D项目是发明成果的重要来源。随着我国政府对R&D资助的进一步增加，如何优化配置这类发明成果的知识产权，使其充分转化利用，已经成为当今知识产权管理的一个重要问题。　　本文运用管理学、法学、经济学和哲学理论，采用比较研究和实证研究的方法，对政府资助R&D项目合同的法律性质、政府资助形成的发明成果知识产权的归属、项目职务发明人的权利等问题进行了深入研究;在考察域外政府资助形成的发明成果知识产权归属制度的基础上，提出了完善我国政府资助形成的发明成果知识产权归属制度的若干建议。　　首先，研究了政府资助R&D项目合同的性质及其当事人相互之间的法律关系;特别研究了参与项目第三方的法律地位，并建立了相应的模型。本文认为，政府资助R&D项目所涉及当事人和所形成的法律关系十分复杂，因此，其发明成果知识产权的归属也要区别不同情况。提出了在确立我国政府资助项目成果知识产权的归属时，应以“有限的放权”为总体的指导思想和三个具体的归属原则，即经济效率原则、利益平衡原则和激励创新原则。　　其次，研究了项目主体各方应该享有的知识产权和必须履行的相应义务，特别是对参与项目第三方的知识产权分享问题作了深入的探究。本文认为，政府资助形成的发明成果知识产权归属于研发单位更有利于其转化利用和促进创新。政府不应该遵从“谁投资谁所有”的市场原则，要求受资方给予充分的利益回报，或将其资助形成的成果知识产权据为已有。当然，政府基于国家利益和公共利益，对其资助项目成果可以行使免费的成果使用权、特殊情况下的所有权和行政介入权。　　最后，研究了项目职务发明人的法律地位，分析了项目职务发明人权利的理论基础及其应该享有的精神权利和财产权利。本文认为，项目职务发明人由于其被雇佣地位，通常情况下不应该享有项目中职务发明的专利申请权和专利权。但是其智力劳动必须得到充分尊重，除了享有署名权等精神权利外，还应该享有一定的报酬权和其他权利。