株高是玉米重要的农艺性状之一。课题组前期以玉米自交系郑58为遗传背景,以昌7-2为供体,通过全基因组分子标记辅助选择获得染色体单片段代换系Z12和W16。Z12和W16在bin2.07区域均含有一个来自昌7-2的染色体片段,株高均显著高于轮回亲本郑58。本研究利用郑58×Z12的F₂分离群体,基于重测序和混合分离分析（BSA）策略,对株高主效QTL qph2-3进行初步定位;利用在目标区间内筛选出的多态性InDel分子标记,基于郑58×Z12和郑58×W16的两个F₂分离群体对qph2-3进行了定位分析;参考B73基因组（RefGen_v4）注释信息,分析定位区间内存在的注释基因。该研究为qph2-3后续的基因克隆和功能分析奠定了基础。主要研究结果如下:1.利用包含743个单株的郑58×Z12的F₂分离群体,运用QTL IciMapping软件和在目标定位区间内筛选出的13对多态性InDel分子标记构建遗传连锁图谱,结合田间株高数据,用完备区间作图法（Inclusive composite interval mapping,ICIM）进行定位分析。结果表明,玉米株高主效QTL qph2-3被定位在InDel分子标记MPH14和MPH20之间。2.利用目标区间内的17对有多态的InDel分子标记和包含1720个单株的郑58×W16的F₂分离群体,将qph2-3定位于InDel分子标记MPH16和MPH20之间,其间的遗传距离为2.15 cM,物理距离为1.59 Mb。3.以郑58×Z12的F₂分离群体为试验材料,利用重测序和混合分离分析（BSA）的试验方法,分析高低池之间△SNP的差异。结果表明,在第2和第6染色体分别存在一个超过95%置信区间的区域,可能是株高QTLs的所在区域。其中第2染色体上的目标区域为13.56 Mb,高低混合池之间在该区域存在6个显著差异的区间;第6染色体上的目标区域为2.157 Mb,高低混合池之间只存在一个差异显著区域。4.参考B73基因组（RefGen_v4）,在InDel分子标记MPH16和MPH20区间存在42个注释基因,其中调控油菜素内酯信号的基因Zm00001d006677可能是qph2-3的候选基因。