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背景和目的:卒中和抑郁症都是由多种因素导致的,遗传和环境都参与两种疾病的发生。卒中后抑郁障碍(PSD)是卒中后常见的并发症之一,会严重影响卒中患者的功能康复及日常生活能力。尽管已经发现某些基因与PSD发生相关,但目前对PSD的遗传基础及相关的病理生理过程仍缺乏了解。本研究旨在通过多通路基因目标测序,寻找中国汉族人群中新型的PSD候选基因及位点。方法:本研究采用二阶段病例对照研究方法,第一阶段共纳入了121例PSD患者,131例卒中后非抑郁(non-PSD)患者和639例健康对照,对其3.5M目标基因区域进行深度测序,通过logistic回归对测得的基因突变位点进行分析以寻找与PSD和non-PSD分别相关的突变位点。接着筛选出54个位点在第二阶段独立样本中(200例PSD,218例non-PSD和983例健康对照)进行重复验证。最后通过meta分析将两组数据合并,寻找在3次分析中均有一致阳性结果的突变位点。其次研究还对阳性位点和基因进行功能注释,功能网络分析及功能聚类分析。结果:在三次分析中,HTR3D和NEUROG3基因均与PSD显著相关(HTR3D,rs55674402,p=0.002512,OR=0.7431;NEUROG3,rs144643855,p=0.00325,OR=0.6523),PIK3C2B基因的3个突变位点与non-PSD显著相关(rs17406271,p=0.0006801,OR=1.446;rs2271419,p=0.0005836,OR=1.497;rs2271420,p=0.001031,OR=1.431)。HTR3D与NEUROG3在脑组织中均有表达,而NEUROG3在海马中表达水平最高。功能网络分析证实HTR3D、NEUROG3基因与既往报道的PSD候选基因有功能连接。对所有PSD候选基因进行功能聚类分析,发现最集中的功能通路为突触化学传递和脂质合成调节。结论:研究在中国汉族人群中新发现HTR3D和NEUROG3基因可能与PSD发生相关,PIK3C2B基因可能与卒中发病相关。功能分析显示PSD相关位点主要参与5羟色胺能突触传递、神经可塑性及脂质合成调节,提示这些基因和生物过程可能参与了PSD的发生,同时也可通过调节、干预这些生物学过程以预防及治疗PSD。