随着经济全球化的不断发展,我国的资本市场日趋完善,多层次资本市场体系已初步建成。对于众多中小企业来说,融资难、融资贵一直是困扰它们的难题。新三板市场恰好为中小企业开辟了一个新的融资渠道。“新三板”是业界对全国中小企业股份转让系统(NEEQ)的俗称,其目的是让那些暂时还没有达到上市要求,但是有较强的发展潜力、符合国家产业政策的高新技术型、创新型、成长型企业能够在新三板市场流通股份,实现融资。但是,目前新三板市场交易并不活跃、市场流动性不足,并不能够满足中小企业的的融资需求,存在一些问题亟待解决。本文在回顾和梳理国内外学者文献的基础上,以融资结构理论和融资效率理论为核心,对新三板市场的挂牌公司现状、融资现状、融资中存在问题进行了整理。从影响新三板市场融资效率的宏观经济环境因素与微观企业自身因素两个角度进行分析,在理论分析的基础上,选取资产总额、资产负债率、营业成本、财务费用作为投入变量,以净资产收益率、总资产周转率、营业收入增长率、每股盈利为产出变量,分别以2015年、2016年和2017年这三年的1259家、4415家和6337家企业的财务指标作为样本,对其进行融资效率测算研究。运用DEA模型中的CCR模型和BCC模型分别测算出样本企业的综合技术效率、纯技术效率,得出新三板市场整体融资效率普遍偏低、绝大部分企业融资规模不足的结论。针对上述结论,本文从新三板市场、政府和企业自身这三个方面提出相应的对策建议,期待能够改善新三板市场融资效率,对企业提升融资效率起到积极作用,促进多层次资本市场健康稳定发展。