2008年金融危机以来，以上下游生产要素整合为目的的纵向交易明显活跃，许多优势企业看到了扩张和“做大做强”的机遇，现实中出现了新一轮纵向整合的浪潮。纵向整合战略的效应通过影响企业绩效和核心能力来表现，进而关键决定企业的持续生存与发展，是企业重要的成长战略。部分实施纵向整合战略的中国企业，通过产业链的延伸带来了规模、范围经济，但因为忽视整合后的监管控制和精细化管理，影响了纵向整合效应的发挥和整合目标的实现，也未能有效提升主业竞争力。尤其在中国转型期背景下，经济和政治的急速变化，制度要素缺乏，产权界定不清，财产保护制度安排缺乏稳定性导致的不确定性给纵向整合企业控制行为带来了高度的制度风险，纵向整合的效果也受到区域发展不平衡等制度环境差异、纵向交易特征等诸多因素的影响。本文基于制度理论、组织理论和交易成本理论，立足于转型期制度情景，分析制度环境不确定性与纵向整合企业控制的关系以及纵向整合企业控制与整合绩效的关系，主要探索以下几个问题：（1）转型经济背景下，制度环境不确定性与纵向整合企业控制的关系如何？（2）制度环境不确定性与纵向整合企业控制的关系是否受到企业能力的影响，如果有，作用机制如何？（3）纵向整合企业控制与整合绩效的关系如何？（4）纵向整合企业控制与整合绩效的关系是否受到制度距离以及交易依赖性的影响，如果有，作用机制如何？本文在文献研究的基础上，构建了制度环境不确定性、纵向整合企业控制、整合绩效的理论框架和概念模型，提出研究假设，采用问卷调查方法以中国境内进行过纵向整合的132家企业为样本数据，运用多元回归分析等多种统计分析方法对理论模型和研究假设进行实证检验，得到如下研究结论：（1）制度环境不确定性与纵向整合企业的战略控制程度、财务控制程度、文化控制程度具有正相关关系;（2）当企业具备的能力条件不同时，在面对不确定的制度环境时，纵向整合企业对于各种控制方式的控制程度是有差异的;（3）纵向整合企业的战略控制程度、财务控制程度、文化控制程度与整合绩效具有正相关关系（4）交易依赖性对于战略控制程度、财务控制程度、文化控制程度与纵向整合绩效的关系具有负向调节作用；（5）制度距离对于战略控制程度、财务控制程度与整合绩效的关系具有负向调节作用。由于现有的纵向整合研究对于整合后控制以及控制与整合绩效关系的研究存在缺失，且基于转型期制度背景的纵向整合研究非常不足，本文重视了纵向整合后企业内部控制的问题，提出了整合后控制影响纵向整合绩效的理论分析框架，整合交易成本和协同效应理论对于纵向整合价值效应的研究，以成本和效率利得的综合衡量方式来评价纵向整合绩效，为企业纵向整合后如何通过有效的控制发挥纵向整合价值效应提供了理论借鉴和实践启示。同时，本文强调转型期制度环境对纵向整合企业内部控制的影响，这在一定程度上发掘了企业控制行为背后制度因素的作用，丰富了环境不确定性的理论内涵和外延，也对纵向整合的情景嵌入式研究的开拓了新视角。