海南百岁老人中线粒体基因突变与女性长寿关联性研究

来源 :中国人民解放军总医院 解放军医学院 解放军总医院 军医进修学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haoz8
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背景和目的:研究指出在长寿老人中普遍保持能量代谢功能,提示线粒体是细胞/组织产生能量的重要器官,并且在人类长寿中有重要作用。有研究指出线粒体基因突变通过降低电子传递链的功能,减少自由基的生成,产生有益于长寿表型的作用。本研究以线粒体基因组为主要研究对象,使用第二代高通量测序技术(NGS)对17个来自海南万宁县的百岁老人的线粒体基因组进行测序,分析mtDNA突变与个体寿命之间的关系,为进一步探讨长寿基因与信号传导通路变化提供依据。方法:本研究中,我们通过评估长寿组和年轻组的线粒体DNA测序结果,对比两组总SNP频率,个体SNP频率,SNPs产生效应,在特定mtDNA区域SNP累积。将变异结果用Burrows-Wheeler Aligner (BWA)比对到线粒体基因组上;用GATK软件对SNP和InDel进行变异检测,用ANNOVAR软件同时关联多个数据库(如dbSNP, 1000g, ESP6500等)对变异结果进行注释。结果:1:选取海南地区,年龄在100岁以上(100±2岁)的女性老人17人。17例百岁老人中文盲17例(100.0%),农林牧渔劳动者13例(76.5%),婚姻状况丧偶15例(88.2%),吸烟17例(100.0%,其中1例已戒烟),饮酒0例,饮茶5例(29.4%),大便1次/1-2d17例(100.0%);有亲属年龄>85岁2例(11.7%),亲属年龄无>85岁11例(64.7%),无法考证4例(23.5%);无重要疾病(心肺脑(老年痴呆))17例(100%);老年性耳聋0例(0%)2:所有mtDNA测序数据和rCRS对比。线粒体总长16596bp,在794个位点上总共发生355个不同的单碱基突变SNV.检测到的突变类型大多数是转换(93.1%的实验组和81.7%的对照组),而颠换、插入和缺失相对较少。3:调查SNP分布显示不同。4:在实验组内发现11个突变位点,所有的实验样本在这些位点上都发生突变;5:在实验组内发现9个突变基因,所有的实验样本在这些基因上都发生突变;6:D-loop突变型在实验组内的频率显著高于对照组(P=0.021);移码突变在对照组内的频率显著高于实验组(P=0.0000);7:线粒体完整性未发现异常;8:发现了3个mtSNPs(m.310T>C或T>TC,m.3105AC>A,m.4048G>A)与长寿关联,其中非同义突变m.4048G>A(Asp248Asn)在功能上可能起重要的保护作用。9:发现4个基因或区域(RNR1, RNR2, "RNR1,TRNF", "TRNP;CYTB,TRNT")在实验组和对照组之间存在显著差异。结论:1.MT-RNR1基因突变可能与百岁老人听力良好相关,MT-RNR2基因突变可能与百岁老人认知能力较强相关;2.ND1在4048位点突变可能减少活性氧簇的产生,与百岁老人长寿相关;3.线粒体基因组突变和线粒体氧化磷酸化功能,能量状态良好,与长寿和衰老相关。
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