HepG2与HepG2.2.15细胞miRNA差异表达谱分析及部分miRNA功能的初步研究

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kldxn
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:miRNA是一类小分子非编码RNA,具有转录后水平调控基因表达的功能。该分子广泛参与生长、发育和疾病发生等过程。目前,miRNA的研究难点是其靶基因的发现。生物信息学方法虽然预测了大量的miRNA的靶基因及其位点,但是只有少部分获得实验数据支持。因此在预测结果基础上,运用基因芯片对部分miRNA进行了进一步筛选,为下一步验证工作提供候选研究对象。 方法:运用基因芯片技术,比较了HepG2和HepG2.2.15细胞的miRNA和mRNA表达谱,并对两种细胞中表达差异显著的miRNA,在TargetScan和PicTar数据库中搜集了预测的miRNA靶基因。由于miRNA在某些情况下能够降解mRNA,对miRNA的靶位点进行进一步筛选可以借助于两种细胞的mRNA表达谱中显示的差异表达基因。初步筛选获得的miRNA与靶基因,主要通过萤光素酶报告基因方法、细胞内过表达或反义抑制miRNA,检测靶基因的表达等实验进行验证。 结果: 1、本研究在HepG2和H印G2.2.15细胞中发现23个表达差异显著的miRNA以及大量差异表达基因。运用生物信息学和基因芯片数据对miRNA的靶基因进行了筛选。 2、完成表达miR-195的重组腺病毒构建,并找出了miR-195在细胞周期调控中调控的靶基因:CCNDI和CDK6。 3、运用反向预测方法,发现了能够调控DUSP1的三种miRNA:miR-101、miR-133、miR-144。实验表明,这三种miRNA在细胞应激中对MAPK信号转导通路具有调控功能。 结论: 1、在生物信息数据库数据分析基础上,运用基因芯片方法,对23种miRNA的靶基因进行了初步筛选,为后续验证工作提供研究对象。 2、对miR-195、miR101、miR-133、miR-144的功能进行了初步研究,获得了上述miRNA的靶基因。
其他文献
目的:研究intermedin( IMD)1-53在心肌肥厚中的作用和机制。方法:腹主动脉缩窄( AAC)制备大鼠心肌肥厚模型,血管紧张素Ⅱ( AngⅡ)诱导心肌细胞肥大。结果:AAC组大鼠HW/BW增加26%( P<0.01),血流
  背景:我们前期的工作表明,大鼠延髓迷走复合体、下丘脑前部等部位均参与束缚-浸水应激(RWIS)反应。以往认为丘脑的主要功能是处理除嗅觉以外的感觉信息,那么丘脑参不参与RWI
  The stimulus for muscle contraction is initiated directly by the spinal motoneurons,it is plausible to suggest that alterations in spinal cord could contrib
会议
海港区、盐湖区土壤中广泛存在着高浓度的氯盐、硫酸盐、镁盐、碳酸豁等多种有害离子,导致这些地区的混凝土结构损伤破坏较快、服役寿命低。混凝土结构损伤是多种有害因素单
  目的:观察全身垂直振动和中等强度跑台运动对去卵巢骨质疏松大鼠股骨生物力学指标的影响。方法:将50 只3 月龄雌性SD 大鼠按体重分层后随机分为假手术和去卵巢手术两组。去
  目的:探讨大鼠内侧前额叶皮层(mPFC,主要是边缘前区PL、边缘下区IL)中的GABA 能神经元和谷氨酸能神经元是否参与束缚-浸水应激(RWIS)反应;在RWIS 过程中PL、IL 突触可塑性
我国是一个幅员辽阔的多山国家,容易遭受各种自然灾害,泥石流作为一种发生频度高的自然灾害,具有高致灾性,严重威胁着生命以及财产安全,所以泥石流防治始终为一项重要的研究课题。水动力因素是导致泥石流发生的基本条件,目前在泥石流消除水动力的截排水分流工程中,全部采用重力流排水形式,此种方式不仅存在着圬工量大、造价高、施工周期长、排水效率低的缺点,而且容易被泥石流所携带的砾石泥沙淤积堵塞,导致整体防治结构失
  Oxidative injury is involved in many diseases,such as ischemic and neurodegenerative diseases.Antioxidant drugs are favorable to relieve the oxidative injur
会议
  目的:探讨游泳运动对攻击行为大鼠肾脏形态及HSP70 表达的影响。方法:健康雄性SD 大鼠42 只,随机分为5 组,安静对照组(A 组,n=8);群居游泳组(B 组,n=8);攻击对照组(C 组,n=8)
  目标 2 型糖尿病增加骨骼肌与肝脏炎性通路核因子kappa B( NF-κB)的活性,伴随着低度炎症反应;但惊奇的是骨骼肌蛋白激酶C(aPKC) 活性受损;肝脏aPKC 活性不变,因此糖尿病状