在借鉴国外大部制经验和总结以往五次机构改革经验教训的基础上，我国政府把大部制作为机构改革的重要方面和主攻方向。现在，它已在全国范围内展开，并取得初步成效和进展。然而，实施改革过程中，也遇到了很多阻力和难题。具体表现在理论准备不够，利益整合、机构整合、机制整合、人员整合的难度增大，中央与地方关系的不协调及垂直管理的阻碍，其他配套措施不健全，外部支持力量弱小等方面。　　本文总结了学界关于大部制改革的理论研究成果，吸收了西方最新的整体政府改革理论，提出大部制改革应包括的四个维度:组织层面、行为层面、制度层面和文化层面。以此为基础，本文建立了大部制改革的理论模型，内容包括新的职能组织结构、新的领导方式和工作方式、新的激励和责任方式、新的权力配置和运作机制、新的文化和价值理念五个方面。另外，为了实施大部制的理论模型，本文还列出了大部制的六大运行机制:公民需求和任务分析，科学合理配置内部权力，业务整合、流程再造，网络连接与资源共享，完善科学的绩效评估体系，跨部门合作与官民共治。　　针对我国大部制改革的现状与问题，本文以此理论模型和运作机制为依据，对大部制改革问题的化解和推进之道给出了六点建议。大部制改革要加大职能转变和机构整合力度，重塑大部文化价值;建立健全决策、执行、监督的制约与协调的机制，保证机构运转顺畅;强化预算和审计的监督作用，建立健全公共预算制度;建立新的激励和监督机制;加大社会事业单位改革，重视法律制度等配套设施的建设;大力提倡善治和服务等价值理念关注政府外部力量;加快信息技术的推广和普及，实现政府网上协同办公;重视公务员的知能培训和开发建设学习型政府组织。　　大部制是未来一段时间我国政府机构改革的一个方向。还应看到，信息时代和风险社会呼吁新的政府组织模式。西方一些国家已开始进入整体政府公共服务模式阶段，而大部制作为整体政府的一部分，二者互相推动。我国也出现了整体政府的萌芽，并与大部制交织发展。可以预测，我国未来大部制改革也将会与整体政府融合共生，成为整体政府组织模式的有机组成部分，共同服役于服务型政府。这是大部制改革的一个方向，也是大部制的可能出路。　　组织理论的发展和西方大部制改革的实践证明，行政组织的分合是客观条件和主观选择共同作用的结果，是组织发展的体现。因此，大部门组织的合并和裁撤也是大部制改革中必然要伴随的现象。随着形势的变化，它必然也会相应的做出调整。应有充分的心理准备和估计。