在真核细胞中,自噬通过将细胞内受损的大分子和细胞器从细胞质运送至溶酶体进行降解。自噬途径对于维持细胞稳态及抵御病原物侵染具有重要作用,该途径在酵母、昆虫和哺乳动物中保守存在。迄今,在酵母中已鉴定了30多种自噬相关基因(autophagy-related genes,ATG),其中,大多数在哺乳动物中都存在同源基因。根据功能的差异,ATG大致划分为六类复合体,包括ATG1激酶复合体、III型磷脂酰肌醇三磷酸激酶复合物(phosphatidylinositol 3-kinase complex,PI3K)、ATG8和ATG12共轭系统、ATG2-ATG18复合体、以及ATG9复合体。目前,关于昆虫自噬基因的种类与进化关系及其与杆状病毒侵染关系的研究非常缺乏。本论文中,基于基因组数据,我们挖掘分析了酵母,人类以及来源于6个目(膜翅目,双翅目,半翅目,虱目,鳞翅目,鞘翅目)的14种昆虫的自噬相关基因。通过蛋白多序列比较、结构域和模序分析、以及进化树构建,我们发现多数自噬基因高度保守地存在于昆虫基因组中。相比较自噬基因在人类基因组中的广泛扩增现象,我们在昆虫基因组中仅发现4个自噬相关基因(ATG4、ATG8、ATG18、Snf1)存在扩增(Expansion)。通过分析苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus,AcMNPV)侵染粉纹夜蛾Tnms42细胞48小时内的转录组数据,我们初步筛选到35个自噬途径相关基因的转录组数据。数据分析表明,在AcMNPV侵染的早期(0-6小时),自噬基因的表达基本保持两个趋势:一部分基因,如AKT、ATG12、ATG24、ATG37、BRE5、FUNDC1、P62、SCH9P、TSC13等显著上调;而另一部分基因的表达则显著下降,如ATG2、ATG13、ATG17、ATG35、ATG101、BNIP3、WIPI1/2、PRKIN等。由于AcMNPV侵染时被转运至细胞核起始复制的时间约在3小时以内,我们推测AcMNPV在入侵过程中与宿主细胞自噬途径存在复杂的相互作用。该项研究为深入探讨杆状病毒入侵机理奠定了一定的基础。