随着围绕海洋的国际争端日益加剧,构建畅达的群岛海运物流网络体系已成为当前我国维护海洋权益、保障海岛居民正常生活的迫切需求。但由于潜在的政治、经济价值和实际需求在以往尚未凸显,因而有关群岛物流的理论研究相对较少。本文首先对国内外区域物流网络构建研究现状、区域物流网络优化模型及算法研究现状、航线配置及运输船队运行规律研究现状、陆岛交通研究现状及南海问题研究现状进行了总结,分析了研究群岛海运物流体系的必要性。其次,对群岛海运物流系统相关的区域物流理论和轴辐式理论进行了详细的研究,并结合群岛的特点,对如何利用上述理论结指导本文物流系统的构建与优化进行了详细的阐述和分析。进而,针对构建群岛物流系统的基本要求,从地理结构、运行环境、运输方式等特殊性出发,通过分析群岛的环境和物资需求特点,建立了群岛海运物流体系各部分的基本结构；随后利用二进制模拟植物生长算法对南海台风持续时间分布曲线进行了拟合,将传统的仓储理论和抗风险因素相结合,建立了针对本文物流体系的抗风险存储理论；同时根据群岛特点,建立了海运系统成本模型。最后,通过分析海运系统成本模型的特点,提出了一种改进遗传算法。经过收集数据,利用编程的手段,对实验算例进行了计算,得到较好的结果,证明了模型和算法的有效性。综上,本文探究了群岛海运物流网络构建与运行的特有规律,拓展了区域物流的研究领域,为我国在群岛建设海运物流网络提供了理论支持和优化方法,因而具有十分重要的理论意义和实用价值。