利用DNA洗牌技术构建GRATEN体系用于基因组编辑的研究

来源 :聊城大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:b411574103
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因突变一直是研究基因功能的最有效方法。随着现代基因组测序技术的迅速发展,大量的基因或其调控因子功能需要鉴定。因此建立精确、高效的基因组定点突变技术,运用反向遗传学方法研究基因(或 DNA)的功能是当前功能基因组学研究的热点之一。人工介导的锌指核酸酶技术(ZFN)、类转录激活因子样效应物核酸酶技术(TALEN)和RNA介导的规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)系统都可以精确地在基因组的特定位点上产生DNA双链切口,进而经细胞内源性修复机制(同源重组修复或非同源末端连接)的修复而实现基因插入、缺失和碱基替换等突变。与传统的基因组编辑技术相比,基因编辑新技术不仅保留了可定点修饰的特点,还可应用到更多的物种上,大大提高了基因定点突变效率,其载体的构建时间缩短,成本降低,为实现基因组定点突变提供广阔的平台。然而,最近的研究发现,CRISPR系统脱靶率非常高。  本研究利用DNA洗牌技术一次性克隆多个基因,并实现一次性定点突变二个氨基酸位点。利用DNA洗牌技术构建了表达载体,首次在植物中利用引导 RNA偶联核酸内切酶(guided RNA and tethered endonuclease,GRATEN)用于基因组编辑,研究GRATEN系统介导的基因组编辑技术在植物基因组中定点突变的可能性。在烟草叶片中瞬时表达,并进行了致突变的初步研究。  GRATEN系统包含蛋白质和RNA二部分,将二组分克隆到同一植物表达载体。蛋白质组分包含来自于噬菌体MS2外壳蛋白(MS2 coat protein,MCP)和核酸内切酶FokI的切割结构域,MCP的N和C端分别融合FokI,表达后形成FokI:MCP:FokI融合蛋白。RNA组分包含串联的指导RNA(guided RNA,gRNA)和MCP结合RNA。gRNA与目标DNA通过碱基配对而识别并结合到靶DNA,MCP以二聚体的形式与形成特定二级结构的RNA结合,由此在靶DNA特定位点形成FokI二聚体,切割DNA,产生双链断裂,经细胞内修复机制(主要为非末端连接,Non-Homologous End Joining,NHEJ)产生碱基替换、缺失和插入等突变。  利用GRATEN系统,我们选择本氏烟草(Nicotiana benthamiana)八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)基因作为打靶基因。结果显示可产生较高(约35.7%)基因突变率。我们的研究结果初步说明GRATEN系统可用于植物(有可能在其他生物)基因组定点突变,为功能基因组研究、基因治疗等提供了一种新的设计思路和技术。
其他文献
近日召开的全椒县十六届人大常委会第二十二次会议听取和审议了4名在全椒的滁州市人大代表履职情况的报告,并进行满意度测评.这是县十六届人大常委会首次开展市人大代表述职
期刊
近日,霍邱县人大常委会召开乡镇人大工作现场观摩推进会.与会人员认为,今年以来,全县乡镇人大工作在整体推进中规范,在全面规范中提升,在提升质效中创新.会议要求,各乡镇人大
期刊
近日,无为县人大常委会调研全县农村养殖业污染治理工作情况.调研组提出4条建议:一是坚持严把准入关,强化源头防控.严格执行畜禽养殖准入审批制度,合理划定养殖区域,逐步实行
期刊
摘要:数学探究学习的一般原理从内涵到形式、从结构到机制、从自身特征到相关因素,涉及众多的内容。數学探究学习是指学生自己或合作共同体针对要学习的概念、原理、法则或要解决的数学问题主动地思考、探索的学习活动,强调的是一种主动参与的学习方式。数学探究学习的典型活动是数学推理,这是数学学科的探究学习区别于其他学科探究学习的根本所在。  关键词:探究性学习;概念;原理;问题解决  中图分类号:G633.6
由于云的分布变化对太阳辐照度的影响,对天空中云的分布进行预测是保证光伏电场稳定利用太阳能发电的重要环节。同时,云图的准确预测对气象分析也具有重要的应用价值。利用气
日前,涡阳县人大常委会组织开展《退役士兵安置条例》执法检查.执法检查组提出,要扎实做好自主就业退役士兵创业就业的服务指导工作,加大职业技能培训,增强就业竞争能力;多措
期刊
随着遥感卫星的应用范围不断扩大、应用需求不断提高,其在日常生活及战争中都扮演着越来越重要的角色。由于遥感卫星成像具有独特的优势,全球和区域尺度的遥感应用对卫星成像数
近日,蚌埠市禹会区人大常委会组织部分市、区人大代表开展旁听庭审活动.此次庭审内容是禹会区法院公开审理的一起涉恶势力犯罪集团案件,28名被告人因涉嫌强迫交易罪、故意毁
期刊
随着英特网和多媒体等业务的发展,用户对接入网络带宽的需求呈指数增长。因为光纤通信具有明显的优势:容量大、传输距离长等,所以光纤被作为一种传输媒质应用到接入网中,用以
改善水生态环境,协调好区域经济、社会发展与水生态环境的关系,是当前社会可持续发展的重要内容。针对用于城市防洪排涝、航运灌溉等诸多用途的平原河网,如何采取多手段、多技术