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2005年4月-2006年7月，调查了宝兴东、西河的鱼类种类组成、分布范围和资源现状，分析了该区域水电梯级开发对鱼类多样性的影响，并提出了相应的保护对策和建议。依据历史资料和本次调查结果，东、西河已知鱼类13种和亚种，录属2目4科7属，可以分为中亚山地区系和中印山地区系。其中，四川省重点保护鱼类有重口裂腹鱼、异唇裂腹鱼、宝兴裸裂尻鱼、侧沟爬岩鳅、青石爬鮡、中华鮡、四川鮡；中国物种红色名录种类有青石爬鮡（极危）、黄石爬鮡（濒危）、中华鮡（濒危）。随着东、西河的上溯，海拔增高，水流量和河道变小，鱼类种类、分类阶元逐渐减少，以至到没有鱼类分布的溪沟。区域内水电开发对鱼类的影响主要包括施工期生产、生活污水的影响，施工开挖、弃渣的影响，施工期工程人员吃鱼要求导致的过度捕捞影响；工程竣工后原有河段成库、减水和脱水，原河流生态环境完全改变后对鱼类栖息环境的影响；工程运转后水库开闸充沙，以及高压水管和水轮机组对鱼类的影响等。因此，水电梯级开发将给原河流中鱼类资源造成极其严重的破坏，但目前对其保护仍然没有引起足够重视，保护力度十分有限。建议在工程建设区内加强渔政管理，改善鱼类生存的环境，加快保护区建设，并将区内特有鱼类宝兴裸裂尻鱼列入我国物种红色名录。调查期间采集了宝兴裸裂尻鱼标本360余尾，对其年龄、生长和繁殖力开展了研究。宝兴裸裂尻鱼的体长、体重呈幂函数相关，相关方程为：W=0.016159×L2.92316。通过与鳞片、鳍条和脊椎骨等其他材料比较后表明，耳石最适合用于鉴定宝兴裸裂尻鱼的年龄，其磨片上年轮清晰，且易于判读。采集样本的年龄为7-19龄，其中以10-13龄最多，占总量的68.75％。相同年龄鱼雌、雄鱼间体型差异较大，雌鱼的体长和体重均大于雄鱼。宝兴裸裂尻鱼体长与耳石大小的相关性极差，不适合用于生长退算，因此无法推算体长、体重生长方程。其体长、体重平均生长率随年龄呈下降趋势，7-18龄雄鱼体长平均生长率分别为0.73-1，51cm／年，7-19龄雌鱼体长平均生长率分别为0.75-2.06cm／年；雄鱼体重平均生长率分别为0.73-2.36g／年；雌鱼体重平均生长率分别为1.85-5.13g／年。个体绝对生殖力为560-5608粒，平均为2481粒；个体相对生殖力为F／L=64.56-366.54粒／cm，平均为154.2粒／cm；F／W=16.7-100.5粒／g，平均40.67粒／g。