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辣椒杂种优势育种是目前辣椒育种中的主要育种技术。辣椒自交系间的遗传关系对杂种优势育种的成败具有重要意义。针对华南地区绿皮尖椒的育种目标,本研究利用新型分子标记——SRAP标记对31个辣椒自交系和4个杂交种的遗传关系进行研究,并和传统的基于基因型值的遗传关系评价方法进行了比较。主要取得如下结果: 对辣椒SRAP反应体系的程序、模板、Mg2+等参数进行优化研究,建立了辣椒SRAP体系:辣椒的PCR程序为94℃预变性5min,94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸1min,5循环,94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸1min,35循环,最后72℃延伸10min;25μl反应体系中,模板量为15ng,Mg2+为2.0mmol/L。新建立的辣椒SRAP体系重复性好、稳定性强。 采用30个引物组合对35个样品进行扩增,其中27个引物组合可扩增出DNA条带。27个引物组合共扩增出310个多态性条带,每个组合的多态性条带数为3～28条不等,平均每个引物组合产生11.5个多态性条带。可见SRAP标记是进行辣椒自交系遗传关系研究的一种有效的工具。 利用5种相似系数对31个自交系的310个SRAP标记基于UPGMA法进行研究,认为Yule相似系数计算方法是辣椒基于分子标记分类的较为合适的方法;基于Yule相似系数,在相似系数GS为0.55处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicum annuum var. grossum变种群和Capsicum annuum var. longum变种群;在相似系数GS为0.7处,将31个自交系分为5类。第一类:7号和9号;第二类:26、27号;第三类:23、25、22、21、20、19、18、17、14、6、11、24、10、15、13、8、16、12、5、4号;第四类是29、28号;第五类是31、30、2、3、1号。 利用5种遗传距离对31个自交系的10个农艺性状的基因型值基于UPGMA法进行研究,认为Steuclid遗传距离计算方法是较为合适的方法;基于Steuclid遗传距离,在遗传距离GD为6.0处,可将辣椒的两个变种分开,即Capsicum annuum var. grossum变种群和Capsicum annuum var. longum变种群;在遗传距离GD为4.6处,可将31个自交系分为5类。第一类:7号,灯笼椒变种;第二类:9号和5号,植株较高大、晚熟、感病;第三类:25号,中抗、矮杆、早熟;第四类:6、12、10、19、14、11、29、31、30、24、16、20、18、17、21、15、13、23、22、8、4号,这一类在植株