水稻抗纹枯病数量基因qSB-9TQ的精细定位

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本研究组之前的研究中,在特青第9染色体初步定位了一个抗纹枯病主效数量基因qSB-9TQ,并以Lemont为轮回亲本,构建了特青染色体目标片段的近等基因系,验证了qSB-9TQ的存在区间。本研究在继续回交的基础上,筛选出遗传背景与Lemont一致的回交单株,构建覆盖目标区间的一组特青染色体单片段叠代系,精细定位qSB-9TQ。构建过程中发现区间内存在一个分蘖角基因qTAC-9TQ,试验确认qSB-9TQ在qTAC-9TQ的右侧,且qSB-9TQ减轻纹枯病的效应明显大于qTAC-9TQ。在qTAC-9TQ右侧构建不包含分蘖角基因的亚区间染色体片段叠代系。共计获得分属13种不同代换基因型的83个亚区间叠代系。这些系连同对照一起,进行了两年大田成株期有重复的接种鉴定试验。利用聚类分析方法确定不同基因型叠代系的相对抗感归属,将qSB-9TQ定位于分蘖角基因右侧InDel标记Y84和Y86涵盖的区间内。进一步发展CAPS标记,根据Y84-Y86区间内各叠代系提供的交换点位置,确定了qSB-9TQ的左右边界,将qSB-9TQ区间缩小至GZ12-Y86之间,两标记间物理距离约为146kb。
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