轻症或重症手足口病患儿HEV71分离鉴定及其VP1基因型分析

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背景:人肠道病毒71型(human enterovirus 71,HEV71)为肠道病毒A组单股正链RNA病毒,是手足口病(hand-foot-and-mouth disease, HFMD)主要病原体。HEV71壳粒由VP1-VP4四种病毒蛋白组成,其中VP1具有细胞受体结合位点、中和抗体表位及抗病毒药物结合位点,故VP1在病毒感染、抗病毒免疫应答及药物治疗效果等方面有重要作用。若VP1功能相关重要位点发生突变,可使HEV71毒力和耐药性发生改变,从而对HFMD患者病情严重程度产生较大影响。HEV71的VP1序列中有一个微小RNA病毒衣壳蛋白样(picornavirus capsid protein domain-like, rhv_like)功能结构域(domain),该结构域含有9个药物结合位点。根据VP1序列差异,HEV71可分为A、B0~5和C1~5基因型,不同地区流行的主要HEV71-VP1基因型可有差异。因此,了解不同地区优势流行的HEV71 VP1基因型及其rhv_like结构域中药物结合位点突变对于HFMD防控及治疗均有较大意义。目的:从不同病情HFMD患儿中分离鉴定HEV71并分析其VP1基因型及rhv_like结构域中药物结合位点突变情况。方法:从2014年浙江省绍兴地区4例轻症和4例重症HFMD患儿标本中分离HEV71并用RT-PCR进行鉴定。采用RT-PCR扩增病毒分离株全长VPl基因并测序。采用专业生物信息学软件,对HEV71分离株进行VP1基因分型、确定VP1基因rhv like结构域中药物结合位点突变情况并构建HEV71分离株系统进化树。结果:HEV和HEV71 RT-PCR检测结果显示,8例HFMD患儿标本中分离的病毒均为HEV71。与GenBank中HEV71参考标准株VP1基因各基因型序列比较,8例HFMD患儿标本中分离的HEV71株VP1基因核苷酸及氨基酸序列均与C4a基因型相似性最高,分别为97.2%~98.8%和99.3%~99.7%。2株分离自2例重症HFMD患儿HEV71株VP1基因hv_like结构域中第179位药物结合位点出现V179L突变。与国内外不同地区HEV71分离株VP1基因比较,5株HEV71分离株与安徽和湖南分离株亲缘关系较近,3株HEV71分离株与上海和山东分离株亲缘关系较近。结论:本地区不同病情HFMD患儿分离的HEV71均为VP1-C4a基因型,重症患儿HEV71分离株VP1基因rhv_like结构域中第179位药物结合位点突变可能与病情严重程度有关。
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