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目的:利用基因测序直接检测乳腺癌中notch3基因的突变率,明确notch3基因突变在乳腺癌中的意义,尝试为乳腺癌提供一个新的高危预测基因。通过比较乳腺癌中notch3突变组与非突变组之间的临床数据,进一步阐明 notch3突变与乳腺癌预后等因素的相关性。 方法:研究对象为汕医肿瘤医院乳腺中心2013-2014年收治的乳腺癌患者,研究标本取自其中50例肿瘤新鲜冰冻组织,提取其基因组DNA后,采用PCR直接测序法探索乳腺癌患者的notch3基因外显子是否含有突变位点。 结果:notch3外显子测序共有8个突变位点,皆为点突变,发生在7个外显子。在8个突变位点中,6个突变位点为沉默突变,2个突变位点为错义突变。6个沉默突变位点分别发生在Notch3受体的胞外区内的EGF-like结构域(5个)、Notch3受体的异二聚体(HD)区(1个),沉默突变最高突变率为exon17处的100%。2个错义突变位点分别发生在Notch3受体的EGF-like结构域、胞内段的PEST结构域,错义突变最高突变率为exon33中PEST结构域处的86.11%。应用Align GVGD对exon33错义突变预测的情况是极大可能改变蛋白质功能,而 PolyPhen2、SIFT则恰恰相反。进一步对发生 exon33错义突变的病例组与非突变组进行临床病理因素(年龄、病理分级、肿瘤大小、腋窝淋巴结、病理分期、ER、PR、Her2、Ki67、分子分型)等进行比较分析,发现两组间各项因素皆无明显统计学意义(P>0.05)。通过利用Notch3抗体进行的免疫组织化学染色分析显示:exon33突变组与非突变组在Notch3阳性信号的胞浆、胞核以及信号强度等方面均无明显差异。我们也对10例乳腺癌癌旁组织进行了 notch3基因外显子的测序分析,结果显示:Exon33突变率为100%,且为同个位点,表明在癌组织中notch3基因Exon33突变为非特异。 结论:我们的研究提示:本课题出现的沉默突变考虑为基因多态性;exon33错义突变并非影响乳腺癌癌变过程的主要驱动因子,在未来的研究中,我们尚需关注潮汕地区正常人notch3基因exon4与exon33序列的特点,也需研究exon4与exon33处的错义突变后Notch3蛋白的功能是否发生改变,进一步明确这些突变是否与乳腺癌形成及预后相关。