【摘 要】
:
目的:通过全基因组重亚硫酸盐测序技术(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)对氯乙烯职业暴露工人外周血有核细胞DNA进行测序,绘制全基因组DNA甲基化改变谱,筛选差异甲基化区域(differentially methylated region,DMR)及差异甲基化基因(differentially methylated gene,DMG),进一步探索氯乙烯致
论文部分内容阅读
目的:通过全基因组重亚硫酸盐测序技术(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)对氯乙烯职业暴露工人外周血有核细胞DNA进行测序,绘制全基因组DNA甲基化改变谱,筛选差异甲基化区域(differentially methylated region,DMR)及差异甲基化基因(differentially methylated gene,DMG),进一步探索氯乙烯致癌的早期生物标志物及其表观遗传机制。方法:收集山东某石化公司氯碱厂(暴露组)及山东某电厂(对照组)职工体检资料及职业接触资料,采集肘部外周血5ml。根据累积接触剂量及微核试验结果,在暴露组与对照组各自筛选3个研究对象,通过WGBS技术对外周血有核细胞DNA进行测序,检测两组全基因组DNA甲基化水平,筛查DMRs和DMGs,并对测序结果进行KEGG通路分析、Gene-Ontology分析等。采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)、琼脂糖凝胶电泳技术在暴露组与对照组各随机选择50个研究对象验证显著差异甲基化基因的甲基化状态。结果:利用WGBS技术在全基因组共筛选出9534个DMRs,其中,4816个DMRs处于低甲基化状态,4718个DMRs处于高甲基化状态。涉及到的DMGs有1333个,其中,细胞凋亡相关基因有BCL2,MADD,TJP2,AEN,TAOK1,BNIP1等,DNA损伤修复相关基因有LIPH,NBN,LIPI,ATM,PFKFB3,GRPEL2等,细胞周期相关基因有LIPH,LIPI,PFKFB3,GRPEL2等,以及与基本生理过程相关基因甲基化水平改变。Gene-Ontology分析结果显示,甲基化水平差异显著基因主要分布在细胞与细胞连接处、胞外区、膜、细胞器等,主要影响蛋白激酶活性,磷脂酶活性、催化活性、受体活性、结构分子活性等功能,涉及细胞死亡及其调节,程序性细胞死亡及其调节,DNA损伤修复的凋亡调节,细胞增殖的调节,自噬调节等生物功能进程。KEGG通路分析发现,甲基化水平差异显著基因富集到癌症,RaP1信号通路、cAMP信号通路、Hippo信号通路、cGMP-PKG信号通路等。MSP及琼脂糖电泳技术对WGBS筛选出的DMGs甲基化改变状况验证发现,BCL2、TJP2、TAOK1、LIPI、LIPH、PFKFB3基因甲基化水平升高,BNIP1、GRPEL2基因甲基化水平降低。结论:氯乙烯暴露引起人外周血有核细胞全基因组DNA甲基化水平升高,筛选出的DMGs可能作为氯乙烯暴露的早期生物标志物。
其他文献
在诈骗罪的认定过程中,不论是定罪还是量刑,都有较为详尽的步骤,并受到较为复杂的因素影响。有学者提出身份公开这一因素在诈骗罪的认定过程中起到排斥的作用。其理论论证的逻辑在于,当受到欺诈行为后存在民事救济的可能性的情况下,刑法应保持谦抑性,避免常见的民事欺诈行为受到刑事制裁。而相对于被害人身份公开的民事欺诈,明显其相对人具有民事救济的可能性,故以身份因素作为判断,具有身份公开因素的欺诈行为要按照先民后
聚乙烯共混材料相比于交联聚乙烯,具有不存在交联副产物且易回收的特点,因此作为一种新型的电缆材料受到越来越广泛的关注。为了开发新一代环保型电缆,提升其绝缘性能,本文选取低密度聚乙烯和高密度聚乙烯共混材料作为基料,选取间氨基苯硼酸、2-甲氧基-5-吡啶硼酸、间氨基苯甲酸和4-二甲基氨基苯硼酸四种电子给-受型电压稳定剂添加入聚乙烯共混物中,对电子给-受型电压稳定剂/聚乙烯共混物的理化性能和电气性能进行分
河口湿地地处河流与海洋相互作用的特殊地带,是响应全球气候变化和人类活动极为敏感的生态系统之一。硫作为继氮磷钾之后的第四位营养元素,因具有多种价态,故其在河口湿地中的生物地球化学循环过程极为复杂,并对全球环境变化具有深刻影响。空间扩展实际上是两个以上有机体或物种之间对所需环境资源或空间不足而发生的竞争,其对植物群落组成、结构和功能具有深刻影响。目前,国内外关于湿地植物竞争的研究多集中于影响竞争力的因
现代网球运动是一项职业化很强的项目,全年比赛众多、对抗强度大,赛季持续时间长,这些都对运动员的体能提出了巨大的考验。而观察近几年的职业男子网坛,不难发现其重大赛事冠军获得者年龄结构的高龄化,统计近5年男子网坛的四大满贯赛冠军的获得者,都是28岁以上的老将(截止到2019赛季结束)。高龄球员能在对体能要求如此之高的男子职业网坛取得这般佳绩,其影响因素有很多,而科学的选赛和训练无疑是其中的重中之重。本
目的:随着直接抗病毒药物(Direct antiviral agents,DAAs)的研发以及部分中心报道的无干扰素全口服抗病毒方案的安全性及有效性,丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)感染患者的预防以及治疗发生了巨大变化,但是由于肾移植患者免疫抑制药物的使用以及易感染等特殊性,使得这类药物在肾移植患者中的使用逐渐成为目前研究热点。本文通过回顾性分析我中心行肾移植术患者,包括
【目的】检测健康对照、慢性乙型肝炎、乙肝肝硬化、乙肝相关性肝癌各组研究对象血清miR-375的表达量,分析其与各组研究对象的临床特征和实验室指标的相关性;并探讨miR-375与HBV-HCC患者预后的关系及在预后评估中的价值。【方法】1.相关性研究部分:于2018年8月-2019年10月在甘肃武威医学科学院肝胆中心收集住院治疗的HBsAg阳性HCC患者以及门诊体检的HBV相关疾病患者作为病例组;并
在高质量发展阶段,环境保护和经济增长的关系如何平衡始终是政府、企业和学界普遍关心的问题。环境污染问题所产生的负外部性,使得市场很难自如的调整至帕累托最优状态,必然导致社会总利益的损失。因此,环境规制便成了缓和环境与社会利益的重要手段。但是任何事情都是有代价的,环境规制也是如此。所以,环境规制问题仍然是一个成本收益问题。于政府而言,如何设计并有效实施合理的环境规制政策使得“绿水青山”与“金山银山”和
本文以太原小店方言中的定语领属作为研究对象,试图全面地记录小店方言的定语领属系统,对其中最为重要的亲属和社会关系进行描写和分析,并通过对比,得出小店方言定语领属的特点和等级序列。为晋语研究和方言定语领属的研究提供有借鉴价值的语料。论文的主要内容包括:第一章绪论部分介绍了小店区概况、小店区方言概述及研究概述、领属关系以及定语领属的研究概况、研究目的和意义等方面的内容。第二章介绍小店方言领属结构的基本
由于在最优控制的数值计算和可观性的反问题中,离散系统关于离散化参数的一致指数稳定性具有重要作用,因而一致指数稳定性得到广泛而深入的研究。众所周知,对指数稳定的波方程的空间变量用经典的有限差分或有限元离散化后,离散格式产生高频病态伪特征模,致使离散系统不是一致指数稳定的。为了恢复一致指数稳定性,学者们引入了添加数值粘性项法和滤波法等方法。然而对于具有动态边界条件的波方程的一致指数稳定性问题研究的较少
目前生物系统参数估计方法的研究受到国内外诸多学者的广泛关注。为了使得到的生物系统参数估计结果更加精确,需要建立与其特点相适应的数学模型,再结合有效的求解方法使得到的模型计算值和实验值更加接近,即使误差函数值降低。本文的主要内容及研究成果如下:1.针对甘油间歇生物歧化过程的过量非线性常微分方程系统,首先给出了以代谢物浓度误差与斜率误差之和为优化目标、以甘油间歇生物歧化过程的过量非线性常微分方程系统为