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寡聚核苷酸(以下简称为oligos)是一种新的荧光原位杂交(FISH)探针,具有序列短、侵染力强、容易人工合成等特点,以其为探针,省去了传统重复序列探针的克隆或扩增、标记等程序,是进行染色体鉴定研究的新一代细胞学标记,因此基于oligos进行的oligopainting成为近年来迅速发展的染色体鉴定新技术,具有很大的应用潜力。南京农业大学细胞遗传研究所已经开发出多个oligos探针套,用于百萨偃麦草和黑麦等染色体鉴定。目前的探针套虽然通过一次FISH即可鉴定全部的小麦染色体,但由于缺少A基因组特异oligos探针,因此有些A组染色体识别困难,需要开发新的oligos探针。本研究利用栽培一粒小麦(Triticum monococcum L,2n=14,AA)基因组测序获得的4.6 Gb的reads,通过生物信息学分析,鉴定出100条重复序列用于开发新的A基因组特异oligos,FISH分析发现16条oligos在随机引物或标准加尾反应标记时可以产生杂交信号,但只有其中的5条经过末端修饰仍可以产生清晰的杂交信号,其中oligos-DPYL36916在16条小麦染色体上产生信号,其中在1A、7A产生特异信号,oligos-DPYL35874产生的信号与混合的oligo-pAs1完全重叠,可以用于D基因组染色体鉴定,丰富了小麦oligos探针标记基础,同时为开发新的A基因组特异oligos提供了参考。利用开发出的oligos探针套#4和oligos-DPYL36916,对普通小麦中国春、中国春-百萨偃麦草双倍体和6个中国春-百萨偃麦草异染色体系包括DS1J(1B)、T2JS-2BS-2BL、DA3JS·4JL、DS5J(5A)、DS6J(6A)和T6JS·2Jl的染色体进行了准确鉴定,同时综合中国春-百萨偃麦草双倍体和6个中国春-百萨偃麦草异染色体系的外源染色体特征,构建了与小麦染色体部分同源性相对应的百萨偃麦草核型,可以识别全部染色体;研究还利用该探针套,鉴定出1个等臂染色体i5JL·5JL和1个涉及1J的大片段易位T1BL-1JL·1JS:研究也综合分子标记分析和细胞学分析,鉴定出20个涉及1J的变异体,其中纯合变异体4个,为转移和利用1J高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)、醇溶蛋白亚基和高蛋白含量相关的基因提供了材料基础。